More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1229 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.86 
 
 
588 aa  1150    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.2 
 
 
597 aa  961    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.03 
 
 
597 aa  959    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.55 
 
 
597 aa  966    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.55 
 
 
597 aa  966    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.2 
 
 
597 aa  961    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.72 
 
 
597 aa  966    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
588 aa  1221    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.42 
 
 
585 aa  962    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.55 
 
 
597 aa  966    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
588 aa  1221    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.56 
 
 
578 aa  845    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.36 
 
 
585 aa  857    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.53 
 
 
597 aa  964    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.72 
 
 
597 aa  967    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.2 
 
 
597 aa  961    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.77 
 
 
593 aa  759    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.9 
 
 
586 aa  856    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.74 
 
 
585 aa  948    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.55 
 
 
597 aa  966    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.16 
 
 
625 aa  594  1e-168  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.93 
 
 
648 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.44 
 
 
646 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.82 
 
 
658 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.38 
 
 
649 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.85 
 
 
637 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 
735 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 
657 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.72 
 
 
656 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 
637 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.05 
 
 
643 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.86 
 
 
637 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.56 
 
 
646 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.71 
 
 
635 aa  329  7e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.17 
 
 
652 aa  329  8e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.96 
 
 
642 aa  329  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.39 
 
 
637 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.37 
 
 
656 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.71 
 
 
646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.32 
 
 
636 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.78 
 
 
647 aa  327  6e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.88 
 
 
662 aa  326  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.68 
 
 
643 aa  326  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.15 
 
 
636 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.61 
 
 
648 aa  322  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  35.33 
 
 
667 aa  322  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.44 
 
 
679 aa  319  7.999999999999999e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
636 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.37 
 
 
672 aa  319  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.23 
 
 
638 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.23 
 
 
638 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.23 
 
 
638 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  36.47 
 
 
646 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
637 aa  316  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.56 
 
 
645 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.66 
 
 
639 aa  313  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.8 
 
 
646 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
659 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.56 
 
 
638 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.3 
 
 
638 aa  310  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.36 
 
 
636 aa  310  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.14 
 
 
638 aa  309  9e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.93 
 
 
644 aa  309  9e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.19 
 
 
637 aa  309  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.48 
 
 
645 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.96 
 
 
666 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.52 
 
 
654 aa  307  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 
638 aa  306  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.33 
 
 
646 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.04 
 
 
646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.84 
 
 
637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  35.08 
 
 
544 aa  303  7.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483354  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.01 
 
 
642 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.32 
 
 
657 aa  300  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.22 
 
 
566 aa  298  1e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.43 
 
 
637 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.75 
 
 
638 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.32 
 
 
637 aa  297  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.74 
 
 
639 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.74 
 
 
640 aa  294  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.86 
 
 
566 aa  292  9e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.08 
 
 
598 aa  291  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.12 
 
 
668 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.55 
 
 
575 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.43 
 
 
638 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.85 
 
 
598 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.95 
 
 
666 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.98 
 
 
566 aa  283  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.99 
 
 
542 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.61 
 
 
579 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.95 
 
 
668 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.07 
 
 
612 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.84 
 
 
674 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.08 
 
 
578 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  32.21 
 
 
596 aa  280  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.28 
 
 
666 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  34.21 
 
 
568 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.55 
 
 
575 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.55 
 
 
575 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.73 
 
 
674 aa  279  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>