More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3157 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  84.96 
 
 
532 aa  859    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  84.77 
 
 
532 aa  858    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
532 aa  1055    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  84.96 
 
 
532 aa  859    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  52.05 
 
 
542 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  48.48 
 
 
535 aa  465  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  49.51 
 
 
549 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.01 
 
 
536 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.31 
 
 
522 aa  415  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.71 
 
 
540 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.99 
 
 
540 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  43.43 
 
 
545 aa  352  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  43.59 
 
 
563 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  42.88 
 
 
526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  42.69 
 
 
532 aa  337  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  26.78 
 
 
576 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.52 
 
 
610 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  27.76 
 
 
579 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  26.94 
 
 
574 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  27.86 
 
 
579 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  27.46 
 
 
579 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.34 
 
 
540 aa  86.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  25.44 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.09 
 
 
579 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  25.6 
 
 
574 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  26.58 
 
 
579 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  24.96 
 
 
578 aa  84  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  31.12 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  31.12 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  26.01 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.94 
 
 
582 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  28.88 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  25.69 
 
 
591 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  24.62 
 
 
580 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  25.43 
 
 
580 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.05 
 
 
574 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  27.57 
 
 
579 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  27.75 
 
 
579 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  27.87 
 
 
579 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  22.84 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.88 
 
 
556 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  27.62 
 
 
578 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  27.62 
 
 
583 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  24.69 
 
 
534 aa  71.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.78 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  25.23 
 
 
863 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  31.5 
 
 
954 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  29.65 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  23.22 
 
 
579 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  27.29 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  27.52 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.78 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.93 
 
 
590 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.93 
 
 
590 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.93 
 
 
568 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  24.93 
 
 
590 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.93 
 
 
590 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.93 
 
 
590 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  26.04 
 
 
522 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  23.12 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  27.16 
 
 
531 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.65 
 
 
542 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  26.64 
 
 
548 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  26.64 
 
 
548 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.63 
 
 
542 aa  65.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  25.87 
 
 
535 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.65 
 
 
543 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  26.99 
 
 
575 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.12 
 
 
638 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  27.51 
 
 
545 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  28.53 
 
 
573 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4056  L-aspartate oxidase  21.93 
 
 
507 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.916074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  24.76 
 
 
574 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  21.38 
 
 
531 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  28.6 
 
 
509 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  25.48 
 
 
532 aa  64.3  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  26.64 
 
 
574 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.64 
 
 
594 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  23.29 
 
 
534 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  29.75 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  23.68 
 
 
531 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  31.19 
 
 
507 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  27.31 
 
 
531 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  23.67 
 
 
584 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  21.44 
 
 
531 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.74 
 
 
646 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  27 
 
 
576 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  25.04 
 
 
587 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.207594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  27.09 
 
 
558 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  26.34 
 
 
545 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  28.34 
 
 
535 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.27 
 
 
606 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  25.93 
 
 
534 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.12 
 
 
648 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.12 
 
 
648 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  24.96 
 
 
571 aa  60.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.12 
 
 
648 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0862  L-aspartate oxidase  24.41 
 
 
549 aa  60.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.04 
 
 
587 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  22.34 
 
 
568 aa  60.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>