More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2626 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  84.96 
 
 
532 aa  885    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  99.25 
 
 
532 aa  1059    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  100 
 
 
532 aa  1066    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
532 aa  1066    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  51.27 
 
 
542 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  47.51 
 
 
535 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.37 
 
 
536 aa  445  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  48.64 
 
 
549 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.33 
 
 
540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.23 
 
 
522 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  47.67 
 
 
540 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.88 
 
 
526 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  43.97 
 
 
532 aa  346  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  43.19 
 
 
545 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  44.16 
 
 
563 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  26.48 
 
 
576 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  27.56 
 
 
574 aa  94  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  28.93 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  29.88 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  29.88 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.6 
 
 
540 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.5 
 
 
556 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  30.9 
 
 
579 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.74 
 
 
610 aa  80.5  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  22.37 
 
 
534 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.49 
 
 
579 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  30.47 
 
 
579 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  29.39 
 
 
579 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  29.39 
 
 
579 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  29.63 
 
 
580 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  25.34 
 
 
578 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  27.97 
 
 
533 aa  77.4  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.21 
 
 
583 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  23.93 
 
 
525 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  28.23 
 
 
583 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  26.79 
 
 
954 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.64 
 
 
543 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  27.59 
 
 
522 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  26.86 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  25.09 
 
 
578 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  27.57 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.79 
 
 
574 aa  70.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  23.82 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  24.31 
 
 
535 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  23.23 
 
 
538 aa  70.5  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  28.96 
 
 
574 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  30.2 
 
 
579 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.74 
 
 
594 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  23.86 
 
 
582 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  30.2 
 
 
579 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  30.2 
 
 
579 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.41 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.36 
 
 
562 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.09 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  24.96 
 
 
580 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  22.26 
 
 
568 aa  68.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.59 
 
 
602 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  22.57 
 
 
579 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  24.24 
 
 
863 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  22.77 
 
 
534 aa  66.6  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  29.27 
 
 
573 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.88 
 
 
606 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.54 
 
 
603 aa  66.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  29.07 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.46 
 
 
611 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  25.65 
 
 
576 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  24.5 
 
 
576 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  26.52 
 
 
531 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.87 
 
 
579 aa  63.9  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  23.79 
 
 
587 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.207594 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.94 
 
 
599 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.33 
 
 
623 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.79 
 
 
587 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  28.82 
 
 
507 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  25.09 
 
 
591 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  26.59 
 
 
535 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  26.77 
 
 
609 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  27.55 
 
 
556 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  26.92 
 
 
545 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.02 
 
 
566 aa  62  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  25.65 
 
 
545 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25 
 
 
601 aa  62  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  29.75 
 
 
569 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.06 
 
 
598 aa  62  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  26.3 
 
 
574 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  24.1 
 
 
536 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  26.52 
 
 
557 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  24.1 
 
 
536 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2527  putative succinate dehydrogenase  27.64 
 
 
578 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  23.58 
 
 
546 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.4 
 
 
605 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  26.22 
 
 
533 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.4 
 
 
605 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  21.51 
 
 
532 aa  60.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  24.77 
 
 
532 aa  60.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  24.09 
 
 
533 aa  60.1  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  25.14 
 
 
535 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  25.14 
 
 
533 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.18 
 
 
566 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.14 
 
 
638 aa  60.1  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>