269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3085 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
526 aa  1061    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  48.55 
 
 
545 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.06 
 
 
522 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  49.02 
 
 
532 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  44.89 
 
 
535 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  44.36 
 
 
542 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  43.91 
 
 
549 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.19 
 
 
536 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  44.08 
 
 
532 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  42.88 
 
 
532 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  43.88 
 
 
532 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.88 
 
 
532 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  42.66 
 
 
540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  44.01 
 
 
540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  42.51 
 
 
563 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.56 
 
 
576 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.53 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.28 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.09 
 
 
556 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  26.38 
 
 
646 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.51 
 
 
540 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  29.26 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  26.89 
 
 
954 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  24.86 
 
 
534 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  25.86 
 
 
578 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.44 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.58 
 
 
542 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  26.72 
 
 
578 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  24.73 
 
 
578 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  26.07 
 
 
591 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  24.52 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.52 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.52 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.52 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.52 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.52 
 
 
568 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.77 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.83 
 
 
588 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.27 
 
 
621 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.33 
 
 
543 aa  66.6  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  23.3 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  23.23 
 
 
576 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  25.37 
 
 
580 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  24.07 
 
 
574 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  24.29 
 
 
556 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25.25 
 
 
582 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 
641 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  25.77 
 
 
574 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.25 
 
 
582 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  24.68 
 
 
515 aa  63.9  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.99 
 
 
542 aa  63.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  21.83 
 
 
534 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  25.93 
 
 
545 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.12 
 
 
591 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.12 
 
 
591 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  23.63 
 
 
561 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  27.66 
 
 
633 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  25.32 
 
 
539 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  24.73 
 
 
528 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  25.41 
 
 
558 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  25.41 
 
 
557 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  26.21 
 
 
583 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.99 
 
 
539 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  23.56 
 
 
574 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  23.56 
 
 
574 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  24.4 
 
 
582 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.98 
 
 
541 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  26.11 
 
 
580 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  24.76 
 
 
538 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  23.97 
 
 
579 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  23.67 
 
 
579 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.63 
 
 
566 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  27.11 
 
 
569 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  22.89 
 
 
584 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  25.71 
 
 
543 aa  57.8  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  23.8 
 
 
515 aa  57.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.24 
 
 
638 aa  57.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.95 
 
 
646 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.49 
 
 
579 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.16 
 
 
644 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.37 
 
 
552 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.92 
 
 
546 aa  57  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  24.82 
 
 
565 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.58 
 
 
627 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.23 
 
 
564 aa  57  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.24 
 
 
589 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.3 
 
 
603 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.48 
 
 
539 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  23.97 
 
 
579 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  23.97 
 
 
579 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.29 
 
 
589 aa  56.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  22 
 
 
532 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.88 
 
 
598 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.18 
 
 
607 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  23.3 
 
 
541 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.18 
 
 
598 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  23.01 
 
 
538 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.18 
 
 
607 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.87 
 
 
602 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.18 
 
 
607 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>