More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0271 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  100 
 
 		 573 aa  1169    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  39.13 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  37.79 
 
 		 579 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  38.61 
 
 		 582 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  38.23 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  38.05 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  38.23 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  38.09 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  38.77 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  37.99 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  36.56 
 
 		 574 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  38.7 
 
 		 578 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  38.19 
 
 		 578 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  38.76 
 
 		 580 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  37.91 
 
 		 579 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  37.91 
 
 		 579 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  36.56 
 
 		 591 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  37.81 
 
 		 574 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  37.81 
 
 		 574 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  37.73 
 
 		 579 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  36.32 
 
 		 576 aa  359  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  37.08 
 
 		 574 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  36.75 
 
 		 578 aa  353  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  37.24 
 
 		 583 aa  352  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.17 
 
 		 610 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  36.76 
 
 		 954 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.62 
 
 		 574 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.41 
 
 		 556 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.71 
 
 		 594 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.99 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.14 
 
 		 590 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.22 
 
 		 564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  23.98 
 
 		 563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.21 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.17 
 
 		 591 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.96 
 
 		 634 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  24.64 
 
 		 568 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  27.08 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.44 
 
 		 562 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.72 
 
 		 567 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.03 
 
 		 567 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.36 
 
 		 635 aa  109  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  27.74 
 
 		 532 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  28 
 
 		 863 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  23.61 
 
 		 542 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  24.79 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  29.53 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.8 
 
 		 659 aa  104  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  23.4 
 
 		 532 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.32 
 
 		 629 aa  104  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  26.33 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  29.95 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  26.01 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  25.26 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  27.04 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  25.96 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  22.76 
 
 		 622 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  26.46 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.43 
 
 		 658 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  26.32 
 
 		 540 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.45 
 
 		 567 aa  101  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.88 
 
 		 629 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  25.09 
 
 		 533 aa  101  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  25.9 
 
 		 538 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  25.59 
 
 		 555 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  22.44 
 
 		 622 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.89 
 
 		 567 aa  99.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.45 
 
 		 598 aa  100  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  25.76 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  26.07 
 
 		 538 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  24.78 
 
 		 567 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  25.84 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  26.14 
 
 		 540 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  27.97 
 
 		 535 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  27.68 
 
 		 560 aa  99.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  25.72 
 
 		 609 aa  99.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  26.14 
 
 		 540 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.62 
 
 		 567 aa  99.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  24.39 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  22.82 
 
 		 632 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  24.39 
 
 		 528 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  26.14 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.51 
 
 		 542 aa  98.2  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  25.26 
 
 		 539 aa  97.8  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.16 
 
 		 657 aa  97.8  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  24.53 
 
 		 535 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  24.31 
 
 		 522 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  24.01 
 
 		 534 aa  97.8  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  23.78 
 
 		 635 aa  97.4  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  25.34 
 
 		 535 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  23.25 
 
 		 565 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  25.04 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  29.67 
 
 		 539 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.73 
 
 		 542 aa  96.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  26.01 
 
 		 540 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.25 
 
 		 570 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  24.91 
 
 		 539 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  25.11 
 
 		 535 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  26.02 
 
 		 530 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.74 
 
 		 664 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>