More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4196 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  67.03 
 
 		 574 aa  783    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  70.32 
 
 		 582 aa  841    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  70.14 
 
 		 582 aa  837    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  71.02 
 
 		 580 aa  844    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  69.43 
 
 		 578 aa  826    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  61.16 
 
 		 569 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  66.96 
 
 		 576 aa  799    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  69.47 
 
 		 579 aa  819    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  69.12 
 
 		 579 aa  833    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  70.49 
 
 		 591 aa  843    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  68.67 
 
 		 574 aa  817    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  92.06 
 
 		 583 aa  1084    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  100 
 
 		 580 aa  1206    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  69.3 
 
 		 579 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  69.65 
 
 		 579 aa  837    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  65.85 
 
 		 574 aa  785    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  69.47 
 
 		 579 aa  819    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  69.3 
 
 		 579 aa  833    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  82.93 
 
 		 578 aa  999    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  66.43 
 
 		 574 aa  797    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  69.65 
 
 		 579 aa  836    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  68.67 
 
 		 574 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  70.31 
 
 		 578 aa  844    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  54.14 
 
 		 954 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.65 
 
 		 610 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  38.76 
 
 		 573 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  30.69 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.98 
 
 		 579 aa  227  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.51 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.51 
 
 		 556 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.91 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.58 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.73 
 
 		 590 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.73 
 
 		 564 aa  157  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  27.06 
 
 		 568 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.56 
 
 		 591 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.28 
 
 		 634 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.96 
 
 		 635 aa  125  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.53 
 
 		 590 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.99 
 
 		 563 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.23 
 
 		 598 aa  121  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.29 
 
 		 625 aa  120  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.02 
 
 		 617 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  24.36 
 
 		 632 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004114  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.5 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.04 
 
 		 659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.88 
 
 		 658 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.32 
 
 		 588 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.95 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  25.13 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.79 
 
 		 635 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.37 
 
 		 622 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.53 
 
 		 588 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.62 
 
 		 539 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.87 
 
 		 590 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.87 
 
 		 590 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.86 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.02 
 
 		 590 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.52 
 
 		 588 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.02 
 
 		 590 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3514  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.2 
 
 		 590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.17 
 
 		 566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.21 
 
 		 562 aa  111  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.92 
 
 		 588 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.52 
 
 		 627 aa  110  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.25 
 
 		 590 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.09 
 
 		 657 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.63 
 
 		 588 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  26.39 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  23.75 
 
 		 622 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.43 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.1 
 
 		 588 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.86 
 
 		 629 aa  109  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3762  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.32 
 
 		 590 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  25.67 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.53 
 
 		 590 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.6 
 
 		 589 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2505  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.25 
 
 		 590 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.09 
 
 		 608 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.26 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.4 
 
 		 588 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  23.62 
 
 		 658 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.55 
 
 		 579 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.74 
 
 		 624 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.34 
 
 		 588 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.9 
 
 		 588 aa  107  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2916  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.55 
 
 		 588 aa  107  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  25.04 
 
 		 591 aa  106  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1835  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.76 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132672  normal  0.110124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.61 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.61 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1142  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.74 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.881943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  24.43 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  25.83 
 
 		 556 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.93 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  25.65 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1786  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.81 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00696319  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  26.99 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.93 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.09 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>