157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1837 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.22 
 
 
635 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 
658 aa  1377    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.6 
 
 
662 aa  785    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  60.42 
 
 
673 aa  811    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.94 
 
 
625 aa  660    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  91.76 
 
 
657 aa  1278    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.36 
 
 
664 aa  777    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.65 
 
 
634 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.73 
 
 
664 aa  787    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.22 
 
 
624 aa  636    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.64 
 
 
663 aa  782    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  92.25 
 
 
658 aa  1293    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.3 
 
 
667 aa  795    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  57.53 
 
 
659 aa  786    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  57.84 
 
 
665 aa  768    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  53.53 
 
 
629 aa  654    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.78 
 
 
635 aa  558  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.07 
 
 
622 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.56 
 
 
622 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  44.27 
 
 
632 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.34 
 
 
629 aa  525  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.87 
 
 
627 aa  520  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.2 
 
 
590 aa  319  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.01 
 
 
591 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.42 
 
 
574 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.04 
 
 
579 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  29.64 
 
 
566 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.52 
 
 
594 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.87 
 
 
563 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  23.84 
 
 
576 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  24.19 
 
 
569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  23.91 
 
 
574 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  22.57 
 
 
574 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  22.57 
 
 
574 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  23.82 
 
 
578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  25.83 
 
 
578 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  23.25 
 
 
579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  23.35 
 
 
579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  23.59 
 
 
574 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  23.47 
 
 
579 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  22.74 
 
 
579 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  23.9 
 
 
578 aa  103  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  22.48 
 
 
579 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  23.04 
 
 
574 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  22.73 
 
 
579 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  22.72 
 
 
591 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  22.56 
 
 
579 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  24.21 
 
 
582 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.76 
 
 
556 aa  97.8  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  23.34 
 
 
580 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  24.05 
 
 
582 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  23.47 
 
 
583 aa  94  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  23.46 
 
 
580 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  21.49 
 
 
610 aa  87.4  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  24.12 
 
 
573 aa  87.4  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  23.1 
 
 
954 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  21.88 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.8 
 
 
564 aa  60.8  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  26.82 
 
 
534 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 
641 aa  57.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.73 
 
 
668 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.45 
 
 
575 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  20.32 
 
 
582 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  27.55 
 
 
538 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.84 
 
 
588 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.98 
 
 
575 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1142  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.34 
 
 
589 aa  53.9  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.881943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.41 
 
 
588 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.72 
 
 
598 aa  53.5  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.02 
 
 
612 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.95 
 
 
566 aa  52.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.64 
 
 
588 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00170465  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  26.6 
 
 
555 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  27.21 
 
 
538 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1786  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.25 
 
 
588 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00696319  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  20.45 
 
 
638 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.17 
 
 
566 aa  51.2  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.31 
 
 
601 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.26 
 
 
663 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  26.16 
 
 
531 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0642  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.99 
 
 
588 aa  50.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  25.44 
 
 
531 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.01 
 
 
589 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.01 
 
 
589 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2185  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.41 
 
 
588 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00800222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.99 
 
 
588 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  24.28 
 
 
542 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.26 
 
 
663 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  25.1 
 
 
533 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.63 
 
 
588 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.29 
 
 
588 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  27.43 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  22.63 
 
 
573 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2916  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.63 
 
 
588 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  28.03 
 
 
534 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.73 
 
 
605 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  25.77 
 
 
533 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.78 
 
 
588 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2912  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.78 
 
 
588 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.303768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00672  hypothetical protein  22.78 
 
 
588 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>