271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2282 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 
622 aa  1302    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  91.64 
 
 
622 aa  1184    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  88.26 
 
 
632 aa  1153    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.04 
 
 
635 aa  616  1e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.61 
 
 
627 aa  566  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.52 
 
 
634 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.49 
 
 
629 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.59 
 
 
657 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.59 
 
 
629 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.19 
 
 
662 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.07 
 
 
658 aa  551  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.92 
 
 
658 aa  551  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.24 
 
 
635 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.7 
 
 
624 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.73 
 
 
663 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.05 
 
 
665 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.32 
 
 
664 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.23 
 
 
667 aa  538  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.62 
 
 
659 aa  538  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.56 
 
 
664 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.78 
 
 
625 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.84 
 
 
673 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.39 
 
 
591 aa  350  4e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  35.19 
 
 
574 aa  339  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.42 
 
 
594 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.68 
 
 
590 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.99 
 
 
579 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.75 
 
 
566 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.41 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.37 
 
 
574 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.37 
 
 
574 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  27.21 
 
 
579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
576 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  26.92 
 
 
569 aa  177  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
579 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
579 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  26.6 
 
 
574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  26.46 
 
 
579 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  26.46 
 
 
579 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  25.75 
 
 
574 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  26.72 
 
 
579 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  26.29 
 
 
579 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  26.03 
 
 
574 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  25.12 
 
 
578 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.53 
 
 
582 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25.2 
 
 
582 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  25.65 
 
 
580 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  24.64 
 
 
578 aa  147  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  25.67 
 
 
578 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  25.32 
 
 
591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  24.62 
 
 
583 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  23.61 
 
 
954 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.37 
 
 
556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  23.75 
 
 
580 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.86 
 
 
610 aa  114  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  22.76 
 
 
573 aa  112  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  23.51 
 
 
582 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.15 
 
 
564 aa  70.1  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.48 
 
 
597 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.28 
 
 
602 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.8 
 
 
611 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  19.48 
 
 
575 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  24.52 
 
 
596 aa  65.1  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  23.87 
 
 
598 aa  64.7  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  28.08 
 
 
641 aa  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.06 
 
 
577 aa  63.9  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.54 
 
 
603 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.6 
 
 
595 aa  63.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  20.93 
 
 
584 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  20.26 
 
 
596 aa  63.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  20.74 
 
 
566 aa  62  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.18 
 
 
579 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.34 
 
 
601 aa  62  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.38 
 
 
596 aa  61.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  21.25 
 
 
573 aa  61.2  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.31 
 
 
612 aa  61.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21330  succinate dehydrogenase subunit A  23.3 
 
 
591 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.92 
 
 
607 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.47 
 
 
583 aa  60.1  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.91 
 
 
583 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.4 
 
 
601 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.14 
 
 
599 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.2 
 
 
595 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  20.81 
 
 
602 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.14 
 
 
576 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.64 
 
 
597 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.19 
 
 
592 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.64 
 
 
603 aa  58.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.8 
 
 
601 aa  58.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.84 
 
 
599 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.73 
 
 
583 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.28 
 
 
589 aa  58.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.28 
 
 
589 aa  58.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.57 
 
 
589 aa  57.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.57 
 
 
611 aa  57.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.81 
 
 
600 aa  57.4  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.24 
 
 
605 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  21.7 
 
 
592 aa  57.4  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.46 
 
 
595 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23 
 
 
591 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>