More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3147 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 		 587 aa  1188    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3969  L-aspartate oxidase  74.87 
 
 		 585 aa  898    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.72 
 
 		 579 aa  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  99.66 
 
 		 587 aa  1186    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.207594 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  65.26 
 
 		 574 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  67.43 
 
 		 591 aa  767    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.43 
 
 		 579 aa  769    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.56 
 
 		 552 aa  309  8e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.48 
 
 		 589 aa  303  7.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.44 
 
 		 539 aa  303  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.21 
 
 		 539 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.26 
 
 		 539 aa  301  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.27 
 
 		 546 aa  300  4e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  36.72 
 
 		 609 aa  290  6e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.79 
 
 		 608 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.47 
 
 		 638 aa  289  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.06 
 
 		 540 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.14 
 
 		 542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.47 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.39 
 
 		 542 aa  279  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.97 
 
 		 644 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.23 
 
 		 646 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.8 
 
 		 648 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.8 
 
 		 648 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.07 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.94 
 
 		 648 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.43 
 
 		 621 aa  270  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.37 
 
 		 543 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  35.7 
 
 		 646 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.67 
 
 		 567 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.54 
 
 		 643 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  38.58 
 
 		 598 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.99 
 
 		 646 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.22 
 
 		 627 aa  264  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.47 
 
 		 567 aa  263  8e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.93 
 
 		 603 aa  263  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.08 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.9 
 
 		 587 aa  262  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.17 
 
 		 644 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.08 
 
 		 637 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  35.7 
 
 		 633 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  35.05 
 
 		 567 aa  256  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.41 
 
 		 587 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  34.45 
 
 		 576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  35.37 
 
 		 567 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  33.33 
 
 		 565 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  34.71 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.91 
 
 		 637 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  33.64 
 
 		 568 aa  253  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.5 
 
 		 567 aa  252  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.06 
 
 		 566 aa  250  6e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.39 
 
 		 595 aa  249  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  31.42 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.1 
 
 		 567 aa  248  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.6 
 
 		 575 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.6 
 
 		 575 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1725  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.46 
 
 		 594 aa  248  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  30.9 
 
 		 542 aa  246  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.26 
 
 		 575 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.09 
 
 		 626 aa  246  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.19 
 
 		 591 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  32.72 
 
 		 537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  32.06 
 
 		 537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  32.54 
 
 		 537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  31.36 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.65 
 
 		 568 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.02 
 
 		 602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1283  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.63 
 
 		 612 aa  244  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.714397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  32.06 
 
 		 537 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  31.66 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.23 
 
 		 567 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  32.06 
 
 		 537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  32.06 
 
 		 537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  32.21 
 
 		 571 aa  244  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  32.06 
 
 		 537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  33.6 
 
 		 570 aa  243  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  32.35 
 
 		 537 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  33.46 
 
 		 528 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1277  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.14 
 
 		 599 aa  243  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.572421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  32.67 
 
 		 596 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  33.76 
 
 		 541 aa  243  9e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  32.17 
 
 		 537 aa  243  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.62 
 
 		 602 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  32.68 
 
 		 601 aa  242  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.62 
 
 		 602 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  32.68 
 
 		 601 aa  242  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.62 
 
 		 602 aa  242  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  31.62 
 
 		 602 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.62 
 
 		 602 aa  242  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  31.62 
 
 		 602 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  30.95 
 
 		 556 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.15 
 
 		 681 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  33.17 
 
 		 598 aa  242  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.62 
 
 		 602 aa  242  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  31.35 
 
 		 532 aa  242  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  31.83 
 
 		 570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.39 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.78 
 
 		 566 aa  240  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  32.27 
 
 		 597 aa  241  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>