More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3969 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.25 
 
 
579 aa  747    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  74.7 
 
 
587 aa  897    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.207594 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  63.19 
 
 
574 aa  707    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  74.87 
 
 
587 aa  898    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  65.25 
 
 
591 aa  748    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3969  L-aspartate oxidase  100 
 
 
585 aa  1197    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  65.79 
 
 
579 aa  752    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.2 
 
 
539 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.36 
 
 
539 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.67 
 
 
539 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35 
 
 
552 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.21 
 
 
608 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.16 
 
 
546 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.06 
 
 
542 aa  290  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.45 
 
 
562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.75 
 
 
589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.13 
 
 
638 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.73 
 
 
644 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.94 
 
 
648 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.94 
 
 
648 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  33.15 
 
 
570 aa  277  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.36 
 
 
540 aa  276  7e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.94 
 
 
648 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.14 
 
 
542 aa  276  8e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.16 
 
 
567 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  34.69 
 
 
609 aa  273  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.84 
 
 
543 aa  273  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.25 
 
 
646 aa  272  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  35.59 
 
 
567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.52 
 
 
598 aa  270  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.11 
 
 
567 aa  266  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.43 
 
 
567 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.95 
 
 
627 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.16 
 
 
575 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.08 
 
 
578 aa  263  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.91 
 
 
646 aa  263  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  35.04 
 
 
598 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.18 
 
 
603 aa  261  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.59 
 
 
567 aa  260  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.76 
 
 
575 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.76 
 
 
575 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.58 
 
 
623 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  34.98 
 
 
646 aa  257  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.58 
 
 
567 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.79 
 
 
590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.79 
 
 
590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  32.31 
 
 
596 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.02 
 
 
644 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.14 
 
 
596 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.19 
 
 
567 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.22 
 
 
621 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  33.15 
 
 
542 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  31.36 
 
 
532 aa  250  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.73 
 
 
643 aa  250  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.11 
 
 
587 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.67 
 
 
637 aa  249  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.87 
 
 
566 aa  249  8e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.42 
 
 
575 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  33.33 
 
 
568 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.35 
 
 
568 aa  248  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.5 
 
 
590 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  31.96 
 
 
573 aa  246  6e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.4 
 
 
587 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.5 
 
 
579 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  33.46 
 
 
590 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  34.96 
 
 
633 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  34.2 
 
 
567 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  33.21 
 
 
576 aa  245  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  32.41 
 
 
528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  30.08 
 
 
582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.33 
 
 
637 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.52 
 
 
566 aa  244  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.92 
 
 
596 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  33.27 
 
 
596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.58 
 
 
582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 
600 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.74 
 
 
596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  33.06 
 
 
641 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.89 
 
 
612 aa  243  7.999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.864322  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.25 
 
 
626 aa  243  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  32.53 
 
 
560 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  30.65 
 
 
534 aa  242  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.96 
 
 
594 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.33 
 
 
598 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.74 
 
 
596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  33.83 
 
 
541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  31.99 
 
 
546 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.86 
 
 
605 aa  241  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.03 
 
 
605 aa  240  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.62 
 
 
581 aa  241  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  32.14 
 
 
601 aa  240  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.21 
 
 
576 aa  240  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  31.12 
 
 
570 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.97 
 
 
575 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.86 
 
 
605 aa  239  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.65 
 
 
595 aa  239  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  30.5 
 
 
538 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  30.35 
 
 
584 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.85 
 
 
596 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  30.59 
 
 
537 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>