More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2912 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  61.75 
 
 
587 aa  739    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00683  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
588 aa  1224    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2912  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  100 
 
 
588 aa  1224    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.303768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.42 
 
 
588 aa  932    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.3 
 
 
601 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.22 
 
 
590 aa  807    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.58 
 
 
587 aa  737    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.01 
 
 
588 aa  1094    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 
592 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.91 
 
 
588 aa  946    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  94.22 
 
 
588 aa  1124    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  53.54 
 
 
596 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.44 
 
 
588 aa  941    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  70.33 
 
 
590 aa  841    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.04 
 
 
589 aa  822    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.04 
 
 
589 aa  822    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.29 
 
 
591 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.5 
 
 
590 aa  843    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  56.09 
 
 
597 aa  650    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  54.29 
 
 
594 aa  673    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 
592 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.43 
 
 
602 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  62.61 
 
 
584 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.1 
 
 
592 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  96.26 
 
 
588 aa  1144    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  56.97 
 
 
587 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.22 
 
 
590 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2630  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.27 
 
 
588 aa  936    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0015925  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.29 
 
 
592 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  82.14 
 
 
588 aa  989    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2505  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.95 
 
 
590 aa  785    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.57 
 
 
588 aa  937    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.54 
 
 
596 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0793  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  97.96 
 
 
588 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83395  normal  0.0589165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  58.84 
 
 
587 aa  693    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0828  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  97.96 
 
 
588 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
591 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2510  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.27 
 
 
588 aa  937    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000247676  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
591 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3762  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.54 
 
 
590 aa  800    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  82.99 
 
 
589 aa  998    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0771  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
588 aa  1224    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.77 
 
 
601 aa  682    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.78 
 
 
590 aa  817    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.24 
 
 
590 aa  983    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00659831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  54.88 
 
 
598 aa  668    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.12 
 
 
591 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2185  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.06 
 
 
588 aa  918    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00800222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0642  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  99.83 
 
 
588 aa  1221    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.75 
 
 
590 aa  821    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.29 
 
 
591 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 
592 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0815  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
588 aa  1224    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.233209  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1786  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.08 
 
 
588 aa  931    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00696319  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.31 
 
 
592 aa  680    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.29 
 
 
591 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.01 
 
 
588 aa  1094    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3514  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.39 
 
 
590 aa  807    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22318  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1797  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  82.2 
 
 
589 aa  958    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000334447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.01 
 
 
588 aa  1094    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.431118  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
591 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.1 
 
 
588 aa  938    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.76 
 
 
588 aa  938    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.93 
 
 
588 aa  939    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
591 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1835  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.91 
 
 
588 aa  929    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132672  normal  0.110124 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2932  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
588 aa  1224    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606648  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.72 
 
 
588 aa  910    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00170465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0767  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  97.96 
 
 
588 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.67 
 
 
590 aa  842    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0736  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
588 aa  1224    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.29 
 
 
591 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
591 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.22 
 
 
590 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.31 
 
 
592 aa  680    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2517  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.27 
 
 
588 aa  936    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000102318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.76 
 
 
588 aa  938    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0890  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  97.96 
 
 
588 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0857  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  97.96 
 
 
588 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.76 
 
 
588 aa  943    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.67 
 
 
590 aa  842    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.44 
 
 
592 aa  673    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  99.83 
 
 
588 aa  1222    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.4 
 
 
588 aa  973    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.04 
 
 
590 aa  830    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.15 
 
 
590 aa  788    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  55.03 
 
 
602 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.44 
 
 
597 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  53.29 
 
 
601 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  82.65 
 
 
588 aa  996    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 
591 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.81 
 
 
601 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>