107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0287 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
461 aa  944    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  71.33 
 
 
457 aa  606  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  33.78 
 
 
459 aa  256  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  34.85 
 
 
445 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.49 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 
423 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  33.7 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  32.67 
 
 
435 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
464 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  32.28 
 
 
448 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  29.08 
 
 
431 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
457 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
475 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.35 
 
 
459 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  31.12 
 
 
491 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
453 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  30.92 
 
 
454 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  31 
 
 
432 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  33.97 
 
 
478 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  30.02 
 
 
457 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  31.76 
 
 
445 aa  160  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
443 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  31.26 
 
 
444 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
468 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
451 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  33.48 
 
 
606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.58 
 
 
618 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  30.56 
 
 
465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
454 aa  140  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 
455 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
421 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  30.57 
 
 
483 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.92 
 
 
600 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  31.14 
 
 
624 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
445 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.82 
 
 
672 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  28.02 
 
 
440 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  28.6 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
462 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
446 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
433 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  27.56 
 
 
421 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
411 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
460 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
483 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
414 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  26.29 
 
 
625 aa  96.7  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.53 
 
 
600 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.98 
 
 
758 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  27.78 
 
 
748 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  23.88 
 
 
680 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  32.67 
 
 
763 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  26.6 
 
 
761 aa  80.9  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.54 
 
 
722 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  24.23 
 
 
531 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  22.52 
 
 
764 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  31.3 
 
 
764 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.14 
 
 
641 aa  70.1  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.95 
 
 
582 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  22.58 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  31.32 
 
 
797 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  32.77 
 
 
465 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  28.4 
 
 
757 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  36.25 
 
 
784 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  27.37 
 
 
706 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  27.92 
 
 
599 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  33.57 
 
 
549 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  23.25 
 
 
568 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  36.36 
 
 
437 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  23.35 
 
 
595 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  32.61 
 
 
619 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  31.16 
 
 
621 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  30.89 
 
 
549 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  26.53 
 
 
547 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.79 
 
 
467 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  28.81 
 
 
669 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  27.34 
 
 
532 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  26.63 
 
 
584 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 
676 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  37.5 
 
 
504 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  27.74 
 
 
463 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  45.76 
 
 
479 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0198  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  51.06 
 
 
627 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2125  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  51.06 
 
 
627 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  41.38 
 
 
527 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  26.63 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
538 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1719  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.9 
 
 
464 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0974339  normal  0.028819 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  25.74 
 
 
527 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.94 
 
 
473 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  28.04 
 
 
518 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 
536 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
537 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>