146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3311 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  97.12 
 
 
460 aa  857    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
468 aa  963    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  57.11 
 
 
455 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  56.67 
 
 
462 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.53 
 
 
472 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
464 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  29.32 
 
 
466 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  30.13 
 
 
454 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 
483 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
457 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.98 
 
 
435 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
475 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  30.18 
 
 
432 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  29.78 
 
 
445 aa  167  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.2 
 
 
459 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
423 aa  157  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  30.39 
 
 
445 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  27.94 
 
 
457 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  29.18 
 
 
478 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
441 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
457 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
453 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  29.7 
 
 
491 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  25.53 
 
 
456 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  28.38 
 
 
448 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30.18 
 
 
624 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  25.79 
 
 
600 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  24.73 
 
 
431 aa  136  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.07 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 
457 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.21 
 
 
672 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  27.27 
 
 
440 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  27.59 
 
 
457 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  27.03 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  27.62 
 
 
606 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  28.6 
 
 
444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  25.93 
 
 
483 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
421 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  25.42 
 
 
421 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  30.95 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  28.03 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  20.95 
 
 
618 aa  73.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.19 
 
 
641 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  22.03 
 
 
433 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  27.97 
 
 
763 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  27.59 
 
 
680 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  32.35 
 
 
748 aa  57  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  38.67 
 
 
582 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  38.67 
 
 
584 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  38.67 
 
 
584 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  23.98 
 
 
550 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.83 
 
 
722 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  26.21 
 
 
764 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  52.08 
 
 
670 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  32 
 
 
599 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.24 
 
 
976 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.24 
 
 
671 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  52.38 
 
 
650 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 
646 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  49.02 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1023  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.16 
 
 
685 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  40.54 
 
 
595 aa  46.6  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.61 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.62 
 
 
758 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  64.71 
 
 
810 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1659  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52 
 
 
748 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  27.74 
 
 
757 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0510  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  47.5 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0251745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.89 
 
 
653 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5071  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  59.46 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  47.83 
 
 
1000 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.65 
 
 
937 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0355  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
686 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.83 
 
 
600 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02950  2,4-dienoyl-CoA reductase, NADH and FMN-linked  47.62 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0620  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.62 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02900  hypothetical protein  47.62 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.11 
 
 
761 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.380231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.61 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.85 
 
 
667 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3263  2,4-dienoyl-CoA reductase  47.62 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3548  2,4-dienoyl-CoA reductase  47.62 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1000  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  50 
 
 
778 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0619  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.62 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3375  2,4-dienoyl-CoA reductase  47.62 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3517  2,4-dienoyl-CoA reductase  47.62 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  41.94 
 
 
596 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  36.36 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
474 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3576  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  51.16 
 
 
672 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.265601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>