94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3216 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 414 aa  839    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 421 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  38.01 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  33.5 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.17 
 
 		 459 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  31.33 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  29.8 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  30.91 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  27.99 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  30.41 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  28.61 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.19 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.89 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  28.57 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 475 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  27.83 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  27.23 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  25.17 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  31.54 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  28.18 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  26.34 
 
 		 764 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  27.54 
 
 		 757 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  29.6 
 
 		 797 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.3 
 
 		 758 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  27.9 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  27.2 
 
 		 761 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  26.27 
 
 		 600 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.67 
 
 		 461 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  26.71 
 
 		 459 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  26.8 
 
 		 624 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  26.01 
 
 		 672 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  23.89 
 
 		 764 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.47 
 
 		 722 aa  86.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 460 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  26.68 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.24 
 
 		 641 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.66 
 
 		 600 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  25.37 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  27.75 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  29 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  22.93 
 
 		 618 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  25.7 
 
 		 748 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  24.65 
 
 		 763 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  33.12 
 
 		 784 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  24.14 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  59.09 
 
 		 501 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  23.74 
 
 		 680 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1768  putative FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  27.22 
 
 		 531 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.51 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 		 496 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2054  putative FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  43.86 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  58.33 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  64.71 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  58.33 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 534 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  52.63 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  43.4 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  51.28 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  24.52 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  41.03 
 
 		 491 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2039  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  24.86 
 
 		 625 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.52 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 554 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  24.55 
 
 		 549 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0412  putative oxidoreductase  45 
 
 		 296 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.224421  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  39.66 
 
 		 506 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5492  putative succinate dehydrogenase  35.09 
 
 		 567 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.31 
 
 		 326 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.75 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  48.98 
 
 		 316 aa  43.1  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>