181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3505 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 462 aa  935    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  56.49 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  56.73 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  54.57 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.38 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 464 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  31.47 
 
 		 454 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  31.94 
 
 		 466 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.12 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 453 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.5 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  28.7 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 454 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  28.45 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  27.98 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  33.33 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 457 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  29.13 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  27.56 
 
 		 491 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 457 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  30.16 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  28.16 
 
 		 624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  25.22 
 
 		 457 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  30.31 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.55 
 
 		 600 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.04 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.11 
 
 		 672 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  29.75 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  22.94 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  30.51 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  28.77 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 606 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  24.94 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  22.25 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  24.63 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  26.9 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  32.85 
 
 		 748 aa  60.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  28.44 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.32 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  23.65 
 
 		 757 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  46.15 
 
 		 810 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  23.92 
 
 		 680 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  28.14 
 
 		 550 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  37.33 
 
 		 584 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  23.87 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  37.33 
 
 		 584 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  26.4 
 
 		 582 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.83 
 
 		 600 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.62 
 
 		 578 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.12 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.22 
 
 		 722 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2165  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.81 
 
 		 610 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.327793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  29.73 
 
 		 764 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  28.05 
 
 		 510 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3855  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  40.48 
 
 		 672 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.9 
 
 		 612 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.89 
 
 		 626 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.67 
 
 		 258 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  53.06 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  24.58 
 
 		 784 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  25.62 
 
 		 763 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  45.21 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  61.54 
 
 		 1000 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0966  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.57 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.289522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.1 
 
 		 647 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42 
 
 		 1013 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  40.91 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1023  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.64 
 
 		 685 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  32.47 
 
 		 599 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  56.1 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.67 
 
 		 589 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  60 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5071  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  60.53 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.1 
 
 		 1073 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.51 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  32.39 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.38 
 
 		 588 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0510  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  51.28 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0251745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 		 589 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 		 589 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 		 589 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>