More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10660  thioredoxin reductase  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  39.13 
 
 
323 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  35 
 
 
309 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  36.72 
 
 
409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  37.67 
 
 
304 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  35.1 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  34.77 
 
 
317 aa  171  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  36.96 
 
 
304 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  35.16 
 
 
340 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.44 
 
 
427 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  35.97 
 
 
311 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  34.33 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  34.33 
 
 
306 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.79 
 
 
319 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  35.33 
 
 
306 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  34.34 
 
 
309 aa  158  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.97 
 
 
407 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.35 
 
 
305 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  32.89 
 
 
310 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 
306 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  34.22 
 
 
306 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  33 
 
 
312 aa  155  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  35 
 
 
335 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
318 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  34.88 
 
 
331 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.1 
 
 
394 aa  152  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  35.08 
 
 
330 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  35.71 
 
 
638 aa  152  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  33.67 
 
 
306 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  32.26 
 
 
569 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  32.54 
 
 
302 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  34.74 
 
 
308 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  34.22 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  35.14 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  33.11 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  32.44 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  35.64 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  33 
 
 
315 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  34.88 
 
 
310 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.79 
 
 
556 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  34.22 
 
 
324 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.01 
 
 
403 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  33.77 
 
 
308 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.37 
 
 
555 aa  146  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  33.11 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  33.22 
 
 
336 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  33.44 
 
 
332 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  34.56 
 
 
318 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  34.45 
 
 
308 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  33.66 
 
 
312 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  33.66 
 
 
312 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  34.42 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  32.44 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  32.67 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  32.23 
 
 
359 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  35 
 
 
322 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  32.01 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  32.01 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  32.01 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  32.46 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  32.01 
 
 
318 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  32.01 
 
 
318 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  32.01 
 
 
318 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  32.01 
 
 
318 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  32.01 
 
 
318 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  31.68 
 
 
318 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  32.01 
 
 
318 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0851  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.99 
 
 
406 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000113815  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 
316 aa  138  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  33 
 
 
313 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  31.88 
 
 
311 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  32.32 
 
 
333 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25220  thioredoxin-disulfide reductase  35.27 
 
 
313 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000419952  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  32.56 
 
 
333 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  33.12 
 
 
555 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  32.24 
 
 
311 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  32.56 
 
 
333 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  32.24 
 
 
311 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  32.56 
 
 
333 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  31.79 
 
 
316 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  31.53 
 
 
308 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  32.12 
 
 
312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  34.49 
 
 
344 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  30.61 
 
 
311 aa  136  4e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  30.2 
 
 
311 aa  136  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  30.56 
 
 
310 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.65 
 
 
567 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  32.65 
 
 
304 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4965  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.23 
 
 
466 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  33 
 
 
304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  30.46 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08910  thioredoxin-disulfide reductase  34.24 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000637944  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  33.66 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  32.75 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  30.49 
 
 
547 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  34.1 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  31.58 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  31.58 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  31.02 
 
 
326 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  31.77 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>