258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2300 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  46.67 
 
 		 416 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  46.15 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  44.52 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  41.62 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  45.06 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  48 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  44.05 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  43.05 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  49.67 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.52 
 
 		 195 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  40.99 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  38.01 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  40.24 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  41.98 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  34.46 
 
 		 210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  45.03 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  36.21 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  37.42 
 
 		 193 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  39.41 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  35.58 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  37.58 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  37.66 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  37.66 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  38.31 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  38.61 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  38.18 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  34.12 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  38.1 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  34.71 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  34.12 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  38.93 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  36.05 
 
 		 205 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  35.56 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  36.42 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  35.37 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  36.73 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  36.2 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  35.76 
 
 		 193 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.4 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  32.94 
 
 		 194 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  39.6 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  37.24 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  38.64 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  30.65 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  37.88 
 
 		 160 aa  85.1  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.48 
 
 		 198 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  35.29 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  32.97 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  32.97 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.75 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  32.16 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  27.38 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  31.93 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  33.99 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  28.82 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  28.83 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  26.87 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  30.39 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.73 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  32.07 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  34.15 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  31.47 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  27.46 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  24.62 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  30.77 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  25.16 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  26.86 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.47 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  29.9 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  29.05 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  25 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  29.92 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  27.91 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  28.78 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.22 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  30.22 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.86 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.77 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  29.95 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  28.78 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  25.71 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  24.32 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  31.78 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  28.37 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  28.88 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  25.19 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  26.29 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  24.46 
 
 		 249 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  24.29 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  27.42 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.08 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2405  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>