77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0725 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  97.93 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  79.79 
 
 		 193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  73.44 
 
 		 193 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  77.33 
 
 		 193 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  65.43 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  62.18 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  62.03 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  59.36 
 
 		 193 aa  233  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  59.36 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  58.03 
 
 		 193 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  60.1 
 
 		 198 aa  230  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  58.29 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  55.91 
 
 		 193 aa  201  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  53.93 
 
 		 210 aa  198  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  45.83 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  47.89 
 
 		 192 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  42.63 
 
 		 192 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  44.39 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  44.33 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  43.75 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  44.85 
 
 		 196 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  42.71 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  43.75 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  44.15 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  44.62 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  44.19 
 
 		 215 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  43.93 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  43.39 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  41.53 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  44.64 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  40.43 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  41.52 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  39.04 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  41.94 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  37.37 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  39.9 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  38.04 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  44.64 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.74 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  42.33 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  38.74 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  35.63 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  37.66 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 416 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  38.62 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  33.12 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  32.45 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  28.97 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.44 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  32.98 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  29.95 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  29.58 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.18 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  26.95 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 		 160 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  29.01 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.56 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  29.67 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  27.32 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  25.37 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.37 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  26.59 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  27.82 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  29.01 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  24.63 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  25.81 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.35 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  26.37 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  26.86 
 
 		 256 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  24.63 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  25.91 
 
 		 213 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>