73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1314 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  44.74 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  47.9 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  42.53 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  39.79 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  40.11 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  38.74 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  39.66 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  39.66 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  38.95 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  37.35 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  39.34 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  37.29 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  44.79 
 
 		 193 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  41.32 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  38.42 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  38.15 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  40.12 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  35.18 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  37.93 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  38.46 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  42.33 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  35.23 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  38.01 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  38.22 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  44.17 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  36.13 
 
 		 200 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.49 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  38.73 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  37.35 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  43.31 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  41.21 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  36.78 
 
 		 193 aa  111  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  36.14 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  35.63 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  35.63 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  30.95 
 
 		 416 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  34.94 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  30.21 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  31.25 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.96 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  35.44 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  33.17 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  31.79 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  32.31 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  28.4 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.44 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  30.68 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  33.15 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  35.22 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  24.86 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  30.29 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  35.88 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  32.57 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  33.14 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  26.75 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.92 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  27 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.29 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  25.45 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  24.29 
 
 		 157 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  19.15 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  23.57 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  29.33 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  27.38 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  22.7 
 
 		 157 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  22.7 
 
 		 157 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>