72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5957 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  100 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  92.23 
 
 		 193 aa  337  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  73.96 
 
 		 193 aa  288  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  74.74 
 
 		 193 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  73.44 
 
 		 193 aa  287  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  73.44 
 
 		 193 aa  287  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  61.26 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  60.96 
 
 		 193 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  61.5 
 
 		 193 aa  225  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  59.89 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  60.43 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  59.36 
 
 		 193 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  58.82 
 
 		 198 aa  221  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  56.15 
 
 		 205 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  53.8 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  52.15 
 
 		 193 aa  191  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  43.75 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  42.71 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  45.83 
 
 		 192 aa  161  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  47.03 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  43.98 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  44.79 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  44.1 
 
 		 212 aa  147  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  41.24 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  46.51 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  40.21 
 
 		 196 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  46.28 
 
 		 193 aa  144  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  40.21 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  38.02 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  39.69 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  41.52 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  42.13 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  41.88 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  44 
 
 		 215 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  35.98 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40.21 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  44.71 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  38.46 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  35.26 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.83 
 
 		 195 aa  121  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  41.67 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  38.25 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  37.43 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  36.14 
 
 		 197 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  33.52 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  38.54 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  34.97 
 
 		 187 aa  97.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  32.48 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  38.3 
 
 		 416 aa  95.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  35.2 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  32.12 
 
 		 204 aa  87.8  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.3 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  28.15 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  30.87 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  31.89 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  30.27 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  30.23 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  29.46 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  27.14 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  30.16 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  29.6 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  26.47 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  31.06 
 
 		 144 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.68 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  24.46 
 
 		 201 aa  42  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2638  putative inner membrane protein  28.97 
 
 		 140 aa  42  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  26.47 
 
 		 145 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  26.01 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>