96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1501 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  55.49 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  48.96 
 
 		 192 aa  191  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  48.59 
 
 		 194 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  47.94 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  47.37 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  50.28 
 
 		 193 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  47.64 
 
 		 192 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  46.03 
 
 		 191 aa  181  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  42.41 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.85 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  39.67 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  37.23 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  38.82 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  35.68 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  37.5 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  37.5 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  38.69 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  36.9 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  37.16 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  38.51 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  32.09 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  39.41 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  34.12 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  35.87 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  29.69 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  38.69 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  36 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  36.5 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  34.13 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  40.72 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  34.52 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  30.11 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  33.93 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  30.21 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  32.98 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  32.42 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  32.45 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  32.45 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  35.12 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  30.98 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.18 
 
 		 198 aa  97.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  31.76 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  34.97 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  32.94 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  29.17 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  29.17 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  33.8 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  29.35 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  30.54 
 
 		 416 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  29.84 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  29.08 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  29.45 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  30.46 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  30.06 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.65 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  25.36 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03488  hypothetical protein  26.47 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002528  hypothetical protein  24.52 
 
 		 153 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  27.59 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  22.56 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  20.29 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  22.9 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  28.22 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1082  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.06 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.55 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  21.68 
 
 		 142 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  25.87 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.71 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  25.56 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  25.6 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  25.6 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  29.27 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  29.27 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2147  putative integral membrane protein  29.13 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.864762  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  25.58 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  29.08 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  28.46 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  28.46 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  28.46 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  28.46 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  28.46 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  21.32 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  21.8 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  28.46 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  31.08 
 
 		 221 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  28.46 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>