27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2915 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  31.08 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  29.93 
 
 
160 aa  57.8  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  31.08 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  31.17 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  29.73 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  32.45 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  30.87 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  29.6 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  29.6 
 
 
193 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  28.22 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  31.82 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  26.15 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  29.23 
 
 
192 aa  44.7  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  25.93 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  31.69 
 
 
191 aa  44.7  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  25.62 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11963  hypothetical protein  23.62 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  27.94 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  26.21 
 
 
197 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  26.61 
 
 
157 aa  41.6  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  23.16 
 
 
193 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 
157 aa  41.2  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 
157 aa  41.2  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>