81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0203 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  42.56 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  45.45 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  46.07 
 
 		 192 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  42.93 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  43.98 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  43.02 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  41.27 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  42.47 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  41.4 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  41.4 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  44.44 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  43.23 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  38.65 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  42.63 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  43.39 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  43.39 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  40.53 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  41.85 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  45.03 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  38.42 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  40.53 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  40.86 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  38.74 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  43.32 
 
 		 191 aa  134  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  46.96 
 
 		 195 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  41.45 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.62 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  40.62 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  38.74 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  40.86 
 
 		 193 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  34.92 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  38.82 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  35.91 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  42.26 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  43.45 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  37.23 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  37.17 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  35.05 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  36.21 
 
 		 416 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  35.05 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  37.58 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  35.05 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  33.68 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  31.72 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  35.03 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  34.88 
 
 		 196 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  34.48 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.86 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  27.06 
 
 		 195 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  34.21 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  33.69 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  26.88 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  25.93 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  30.86 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  28.42 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  29.44 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  30.26 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  29.89 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.31 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 		 157 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  29.55 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.79 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  27.69 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  27.21 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  27.01 
 
 		 157 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  30.87 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  29.83 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  24.26 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  27.48 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  26.67 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  24.64 
 
 		 160 aa  41.6  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  25.9 
 
 		 144 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  25.2 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  27.14 
 
 		 167 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  26.36 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  25.56 
 
 		 140 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>