128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0262 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  94.9 
 
 		 157 aa  295  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  89.17 
 
 		 157 aa  283  7e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  57.96 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  52.98 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  37.24 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  35.86 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  37.24 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  26.95 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  28.17 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  32.09 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  32.09 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  31.54 
 
 		 252 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  23.57 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  22.48 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  28.24 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.46 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.24 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  27.21 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  28.28 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0365  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  22.9 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.09 
 
 		 206 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  24 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0386  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369769  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 		 208 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  28.89 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  27.83 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  29.9 
 
 		 268 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  22.9 
 
 		 416 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  30 
 
 		 195 aa  47.4  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  26.89 
 
 		 145 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.54 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  25.66 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4633  hypothetical protein  25.19 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  31.76 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0535  putative transmembrane protein  25.19 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  23.29 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1579  hypothetical protein  25.56 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.21 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  24.53 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  25.66 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  22.22 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  25.19 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1082  SNARE associated Golgi protein-related protein  25 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  28.89 
 
 		 202 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  24.29 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1618  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  25.76 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0487  putative transmembrane protein  29.31 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.528398  normal  0.0272623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 		 237 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.48 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  26.47 
 
 		 217 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  25.95 
 
 		 210 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  23.02 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  28.89 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1129  hypothetical protein  25.95 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0566076  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  25 
 
 		 191 aa  43.9  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30.63 
 
 		 200 aa  43.9  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  26.71 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  26.56 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0366  hypothetical protein  24.18 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  26.71 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  25.62 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  28.12 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.47 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  21.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  31.07 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2910  hypothetical protein  25.37 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  28.36 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.32 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  19.7 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  24.44 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  23.68 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  27.74 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  26.87 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  24.68 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11963  hypothetical protein  29.01 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  27.54 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.01 
 
 		 623 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0574  hypothetical protein  24.03 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  33.66 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  28.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01067  membrane protein-like protein  19.05 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  26.72 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  25.88 
 
 		 198 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  28.1 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  27.82 
 
 		 199 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 230 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  27.13 
 
 		 206 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>