95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3196 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  100 
 
 
200 aa  394  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  50.81 
 
 
198 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  48.68 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  49.47 
 
 
198 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  48.13 
 
 
205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  49.73 
 
 
193 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  48.66 
 
 
193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  46.6 
 
 
193 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  45.95 
 
 
210 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  45.41 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  44.68 
 
 
193 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  45.95 
 
 
193 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  44.15 
 
 
193 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  44.15 
 
 
193 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  44.44 
 
 
193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  46.35 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  47.37 
 
 
193 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  46.88 
 
 
192 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  43.37 
 
 
212 aa  157  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  45.31 
 
 
192 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  43.78 
 
 
192 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.2 
 
 
195 aa  151  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  44.57 
 
 
183 aa  147  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  44.92 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  46.32 
 
 
196 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  43.32 
 
 
194 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  41.67 
 
 
192 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  49.37 
 
 
194 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  44.33 
 
 
215 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  43.1 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  37.56 
 
 
197 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40.76 
 
 
198 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  38.71 
 
 
196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  37.17 
 
 
214 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  41.79 
 
 
196 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  39.46 
 
 
191 aa  134  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  36.13 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  42.77 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  41.79 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  42.55 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  38.62 
 
 
195 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  42.78 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  42.13 
 
 
192 aa  128  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  44.51 
 
 
193 aa  127  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  40.72 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  53.85 
 
 
194 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  39.31 
 
 
195 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  34.59 
 
 
416 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  34.9 
 
 
206 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  35.29 
 
 
187 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  33.56 
 
 
190 aa  98.2  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  33.68 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  32 
 
 
195 aa  95.1  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  31.18 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  34.59 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  34.59 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  28.89 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  34.59 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4193  membrane protein-like protein  28.47 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  28.89 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  28.89 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  28.89 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3715  membrane protein-like protein  28.89 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  28.36 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  30.06 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  30.19 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  26.43 
 
 
159 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.9 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  23.48 
 
 
145 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 
160 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  26.72 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  26.09 
 
 
160 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  23.36 
 
 
142 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  24.66 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  22.76 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  24.48 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  26.71 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  32.14 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  32.14 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  32.14 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  24.09 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.86 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  26.98 
 
 
151 aa  42.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  25.83 
 
 
202 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.34 
 
 
221 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  27.09 
 
 
221 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2638  putative inner membrane protein  24.24 
 
 
140 aa  41.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  25.83 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.06 
 
 
201 aa  41.2  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  26.06 
 
 
153 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>