89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0411 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 195 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  69.23 
 
 		 195 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  47.85 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  46.96 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  44.79 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  49.68 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  39.18 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  40.62 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  41.15 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  41.18 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  41.71 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  41.18 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  41.71 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  40.64 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  41.18 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  41.57 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  44.44 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  39.38 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  39.06 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  39.18 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  37.08 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  37.5 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  42.07 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  38.3 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  39.15 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  38.14 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  39.04 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  39.04 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  37.77 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  38.95 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  37.63 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  41.57 
 
 		 194 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.87 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  38.64 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  38.86 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  37.31 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  34.41 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  31.25 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  36.31 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  37.29 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  40.27 
 
 		 416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  32.99 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  32.82 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  32.82 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  35.5 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.04 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.96 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  28.82 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.57 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  32.75 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  31.49 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  31.49 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  32.34 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  32.04 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  31.84 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  31.18 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  29.55 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  29.55 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  30.3 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  26.83 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  21.43 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  30.87 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  23.02 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  22.22 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.9 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  22.98 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  22.4 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  21.37 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  23.13 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  22.33 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1082  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.68 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  21.79 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  26.35 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  22.16 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  19.7 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  22.81 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  26.35 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  29.17 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  19.7 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  22.93 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  19.38 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  19.27 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  21.28 
 
 		 232 aa  42  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.43 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  22.42 
 
 		 207 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  26.9 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  21.74 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>