63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1994 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  100 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  98.04 
 
 		 204 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  75 
 
 		 204 aa  310  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  57.84 
 
 		 204 aa  238  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  46.2 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  43.78 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  42.05 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  39.27 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  41.4 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  38.14 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.36 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  38.07 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  38.62 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  36.5 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.54 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  34.41 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  32.11 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  33.12 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  30.94 
 
 		 195 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  32.31 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  31.02 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  36 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  32.07 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  32.76 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  34.12 
 
 		 416 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  33.71 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  30.86 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  33.85 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  34.59 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  34.42 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  31.96 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  33.95 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  34.62 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  31.28 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  32.6 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  29.89 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  29.23 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  26.54 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  33.55 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  32.72 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  32.69 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  30.27 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  27.89 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  29.67 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  29.67 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  29.67 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  29.94 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  30.85 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  29 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  25.26 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  25.26 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  25.26 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  27.98 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  25.52 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  31.25 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  26.49 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  31.39 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  26.21 
 
 		 159 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  28.89 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>