68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0958 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  80.83 
 
 		 198 aa  317  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  78.24 
 
 		 193 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  78.24 
 
 		 193 aa  314  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  77.72 
 
 		 193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  78.24 
 
 		 198 aa  309  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  74.35 
 
 		 205 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  63.64 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  62.03 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  62.03 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  61.7 
 
 		 193 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  64.21 
 
 		 193 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  61.5 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  62.21 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  52.85 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  51.85 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  51.6 
 
 		 192 aa  187  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  48.66 
 
 		 192 aa  174  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  47.59 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  46.84 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  47.09 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  46.81 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  47.09 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  47.06 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  43.92 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  47.67 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  46.81 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  44.44 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  44.74 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  43.6 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  42.63 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  42.62 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  45.56 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  38.95 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  40.21 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  43.43 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  39.43 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  38.51 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  43.11 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  39.53 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  41.92 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  35.79 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.12 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  35.96 
 
 		 416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  37.36 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  39.77 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  38.93 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  35.12 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.21 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  36.77 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  27.39 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  34.42 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  32.08 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  33.55 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  32.9 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.5 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  27.21 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  29.92 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  27.05 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  25.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.5 
 
 		 202 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  26 
 
 		 202 aa  42  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  29.07 
 
 		 206 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.8 
 
 		 203 aa  42  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>