87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1822 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
193 aa  381  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  62.83 
 
 
193 aa  248  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  60.21 
 
 
191 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  61.7 
 
 
193 aa  224  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  58.15 
 
 
192 aa  222  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  61.45 
 
 
194 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  55.21 
 
 
192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  57.38 
 
 
183 aa  204  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  53.93 
 
 
195 aa  202  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  48.69 
 
 
191 aa  187  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  62.43 
 
 
194 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  45.6 
 
 
204 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  44.78 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  43.09 
 
 
193 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  48.82 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  46.6 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  45.74 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  47.06 
 
 
193 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  45.55 
 
 
204 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  48.68 
 
 
192 aa  140  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  44.86 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  40.96 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  40.96 
 
 
193 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  40.96 
 
 
193 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  46.67 
 
 
192 aa  137  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  44.44 
 
 
193 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  43.89 
 
 
193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  43.89 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  41.52 
 
 
210 aa  131  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  40.64 
 
 
193 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  37.97 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  39.78 
 
 
214 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  48 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  42.78 
 
 
198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  43.11 
 
 
193 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  43.86 
 
 
205 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  40.76 
 
 
194 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  36.93 
 
 
195 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  38.25 
 
 
212 aa  121  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  39.66 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  40.59 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  41.21 
 
 
197 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  35.79 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  41.99 
 
 
200 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  43.66 
 
 
416 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  39.08 
 
 
195 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  36.26 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  32.28 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  35.87 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  35.87 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  35.23 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  34.95 
 
 
196 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  35.03 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  34.22 
 
 
196 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  36.54 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  31.9 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  36.72 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  32.56 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
160 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  29.56 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.01 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  29.01 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  30.23 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  30.23 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.4 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  26.63 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.65 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  34.4 
 
 
228 aa  45.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  23.6 
 
 
214 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  29.23 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  27.62 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  28.31 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  29.85 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.52 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  28.33 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
157 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  29.01 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  24.82 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  24.22 
 
 
142 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3328  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
140 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  34.68 
 
 
206 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  26.01 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  27.86 
 
 
206 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.27 
 
 
221 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>