80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0479 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  65.43 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  65.43 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  64.89 
 
 		 193 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  65.95 
 
 		 193 aa  240  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  65.26 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  64.21 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  64.21 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  61.78 
 
 		 193 aa  235  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  61.58 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  64.53 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  62.43 
 
 		 198 aa  232  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  64.21 
 
 		 193 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  60.32 
 
 		 198 aa  225  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  58.38 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  55.5 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  49.19 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  49.21 
 
 		 192 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  50.79 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  47.42 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  47.42 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  48.4 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  51.67 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  46.6 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  45.16 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  48.68 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  48.26 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  46.33 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  44.74 
 
 		 212 aa  150  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  45 
 
 		 198 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  44.25 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  41.36 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  38.42 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  37.3 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  36.92 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  39.89 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.85 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  44.72 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  41.57 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  43.02 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  40.54 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  39.11 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  39.27 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  40.83 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  38.42 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  39.74 
 
 		 416 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  35.58 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  31.76 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  37.65 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.48 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  30.98 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  32.62 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  31.84 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  26.35 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  30.3 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  31.96 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  30.93 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  30.66 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  27.21 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  25.74 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  28.03 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  28.47 
 
 		 145 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  28.08 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.22 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  27.78 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  24.26 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.29 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.25 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  27.74 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  28.99 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  26.19 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  28.46 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.44 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  23.7 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0190  uncharacterized membrane-associated protein  24.06 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  23.2 
 
 		 195 aa  42  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>