79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1827 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  377  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  63.84 
 
 
193 aa  235  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  64.48 
 
 
191 aa  230  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  59.22 
 
 
194 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  56.52 
 
 
192 aa  207  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  52.88 
 
 
195 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  55.38 
 
 
193 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  51.79 
 
 
192 aa  192  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  53.04 
 
 
183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  42.41 
 
 
191 aa  166  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  55.03 
 
 
194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  46.63 
 
 
204 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  43.09 
 
 
193 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  49.72 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  42.41 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  48.24 
 
 
192 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  46.41 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  47.22 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  48.04 
 
 
198 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  46.11 
 
 
193 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  44.86 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  46.67 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  47.62 
 
 
193 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  44.28 
 
 
204 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  41.49 
 
 
193 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  41.71 
 
 
192 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  40.43 
 
 
193 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  40.43 
 
 
193 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  45.21 
 
 
193 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  41.45 
 
 
214 aa  134  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  43.78 
 
 
204 aa  134  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  45.56 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  43.58 
 
 
198 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  41.21 
 
 
195 aa  130  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  41.57 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  44.19 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  43.05 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  41.53 
 
 
193 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  44.92 
 
 
200 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  41.42 
 
 
210 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  42.33 
 
 
197 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  37.22 
 
 
212 aa  121  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  38.42 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  38.82 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  40.23 
 
 
195 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  34.21 
 
 
222 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  36.97 
 
 
196 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  34.64 
 
 
196 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  39.76 
 
 
196 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  38.03 
 
 
416 aa  99.4  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  39.31 
 
 
195 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  39.86 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  34.48 
 
 
195 aa  94  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  34.91 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  31.08 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 
159 aa  72  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  32.87 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  32.81 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  34.59 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  32.81 
 
 
160 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.92 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.61 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  24.79 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  24.79 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
157 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  29.63 
 
 
217 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  28.1 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  28.89 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  26.67 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  25.78 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  24.37 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  25.53 
 
 
143 aa  42.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  22.88 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.91 
 
 
206 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.53 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>