59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1641 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  381  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  93.33 
 
 		 196 aa  357  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  74.74 
 
 		 196 aa  292  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  71.35 
 
 		 196 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  72.34 
 
 		 195 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  73.89 
 
 		 198 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  46.91 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  47.42 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  49.74 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  46.91 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  45.36 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  48.97 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  48.68 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  47.37 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  47.94 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  47.09 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  46.32 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  43.75 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  43.75 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  43.75 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  43.81 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  41.24 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  42.86 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  41.67 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  40.72 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  38.14 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  39.66 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  40.8 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  39.9 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  41.71 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  39.08 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  41.79 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  35.05 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  39.2 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  35.26 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  32.49 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  35.61 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  37.44 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  31.58 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  35.19 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.71 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  32.82 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  29.17 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  32.97 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  33.33 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  34.12 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  25.34 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  23.84 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  27.43 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.29 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  22.96 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  24.84 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  25.79 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  25.26 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>