90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0757 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  78.76 
 
 		 193 aa  318  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  52.04 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  52.85 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  55.5 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  52.36 
 
 		 193 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  50.51 
 
 		 198 aa  208  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  51.31 
 
 		 193 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  49.74 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  48.44 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  54.45 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  53.93 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  53.93 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  53.23 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  57.06 
 
 		 193 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  56.47 
 
 		 193 aa  191  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  49.46 
 
 		 192 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  45.16 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  45.36 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  45.95 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  43.48 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  41.94 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  45.61 
 
 		 192 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  44.77 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  38.65 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40.57 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  40.96 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  42.05 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  38.1 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  43.6 
 
 		 192 aa  138  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  39.77 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  36.17 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  42.69 
 
 		 194 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.27 
 
 		 195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  39.33 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  37.17 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  41.52 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  42.33 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  39.34 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  38.89 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  41.42 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  41.1 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  34.46 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  31.45 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  34.12 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  35.5 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.44 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  38.26 
 
 		 416 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  35.86 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  30.86 
 
 		 190 aa  99  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  33.13 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  32.31 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  28.9 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  31.79 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  24.39 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  27.94 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  33.9 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  25.55 
 
 		 145 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 159 aa  48.1  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  24.06 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  24.87 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.56 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.81 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  25.28 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.59 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  29.23 
 
 		 160 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 143 aa  45.1  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  27.16 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  25.95 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  25.19 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  26.28 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.92 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  24.09 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  23.31 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  24.26 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  28.46 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  24.26 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 325 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 157 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.39 
 
 		 231 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  23.37 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  24.82 
 
 		 157 aa  41.6  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  21.8 
 
 		 143 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  21.8 
 
 		 143 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  21.8 
 
 		 143 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>