57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3343 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  100 
 
 
214 aa  425  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  30.67 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  28.82 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  27.78 
 
 
187 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  30.15 
 
 
416 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  24.7 
 
 
210 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  27.65 
 
 
195 aa  58.2  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  32.79 
 
 
140 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  25.3 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  26.85 
 
 
162 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 
157 aa  52  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1327  hypothetical protein  27.05 
 
 
140 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0199997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3064  hypothetical protein  30.25 
 
 
141 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3328  SNARE associated Golgi protein  26.23 
 
 
140 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3561  hypothetical protein  27.73 
 
 
141 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1130  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3162  hypothetical protein  29.41 
 
 
141 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3262  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.175834  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  25.84 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.68 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  24.65 
 
 
160 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1096  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1029  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2982  hypothetical protein  29.41 
 
 
141 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  25.16 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1056  hypothetical protein  29.66 
 
 
138 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
159 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  25.7 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01067  membrane protein-like protein  33.66 
 
 
132 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  26.42 
 
 
157 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.67 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  25.86 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  27.01 
 
 
193 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  26.44 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  27.81 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  26.44 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  23.49 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  27.27 
 
 
183 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  29.37 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1034  hypothetical protein  27.97 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  31.13 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  26.62 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  23.68 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3374  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  21.83 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0353  hypothetical protein  25.52 
 
 
148 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  24.49 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  26.95 
 
 
153 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  27.21 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  25.28 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2405  hypothetical protein  26.23 
 
 
145 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  32.08 
 
 
160 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  24.85 
 
 
206 aa  41.6  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  24.75 
 
 
192 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  25.42 
 
 
142 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  25.79 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>