97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2492 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  100 
 
 
192 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  69.79 
 
 
192 aa  271  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  51.6 
 
 
193 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  49.19 
 
 
193 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  49.47 
 
 
198 aa  184  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  49.47 
 
 
193 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  49.47 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  45.83 
 
 
193 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  45.83 
 
 
193 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  48.92 
 
 
205 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  45.31 
 
 
193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  48.4 
 
 
193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  48.7 
 
 
194 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  47.34 
 
 
198 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  47.4 
 
 
192 aa  170  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  44.74 
 
 
193 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  45.16 
 
 
210 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  45.36 
 
 
196 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  49.13 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  46.2 
 
 
193 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  45.36 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  45.36 
 
 
222 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  45.03 
 
 
193 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  45.41 
 
 
195 aa  157  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  44.27 
 
 
195 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  44.27 
 
 
212 aa  154  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  45.2 
 
 
198 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  47.95 
 
 
215 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  42.93 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  39.89 
 
 
193 aa  151  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  46.29 
 
 
196 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  42.78 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  46.41 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  46.11 
 
 
192 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  45.5 
 
 
191 aa  140  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  47.06 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  38.95 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  46.67 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  39.18 
 
 
197 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  45.31 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  43.45 
 
 
183 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  40.12 
 
 
197 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.22 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  40.24 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  48.03 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  34.95 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  40.62 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  39.47 
 
 
416 aa  108  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  35.29 
 
 
204 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  38.69 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  35.9 
 
 
204 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  32.03 
 
 
190 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  29.05 
 
 
195 aa  98.2  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.15 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  31.29 
 
 
197 aa  84.3  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  32.09 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  31.02 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 
160 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  29.2 
 
 
160 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.74 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  29.14 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.53 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  28.85 
 
 
212 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  29.92 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  28.28 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  26.15 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  23.94 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  26.16 
 
 
202 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  31.82 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  30.13 
 
 
246 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1327  hypothetical protein  26.03 
 
 
140 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0199997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  26 
 
 
206 aa  44.7  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 
267 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.81 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.61 
 
 
207 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  25.15 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  30.33 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26.98 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  25.47 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  28 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.37 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  23.29 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  30.33 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  30.71 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  21.93 
 
 
160 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.25 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  26.06 
 
 
140 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  26.15 
 
 
213 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2124  hypothetical protein  32.56 
 
 
260 aa  41.6  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>