159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03725 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  64.29 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  55.49 
 
 		 191 aa  209  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  57.14 
 
 		 192 aa  208  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  56.18 
 
 		 193 aa  205  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  60 
 
 		 194 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  59.17 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  53.04 
 
 		 193 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  55.06 
 
 		 191 aa  188  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  53.04 
 
 		 195 aa  188  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  57.78 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  44.02 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  37.78 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  42.42 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  41.36 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  42.04 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  42.11 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  41.52 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  41.52 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  38.46 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  40.76 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  37.99 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  39.23 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  40.13 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  40.13 
 
 		 193 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  45.06 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  40.54 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  38.12 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  38.98 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  36.57 
 
 		 212 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  41.06 
 
 		 193 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  43.45 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  38.89 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  45.35 
 
 		 200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  39.74 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  39.53 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  35.96 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  38.36 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  39.15 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  38.62 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  40.62 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  35.52 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  37.72 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  35.93 
 
 		 416 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  35.16 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  35.19 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  32.22 
 
 		 222 aa  98.2  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  34.83 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  36.97 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  30 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  31.72 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  38.64 
 
 		 159 aa  84.3  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  33.99 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  33.85 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  31.46 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  31.08 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  28.23 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  31.68 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002528  hypothetical protein  30.17 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.28 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03488  hypothetical protein  29.31 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  27.62 
 
 		 248 aa  51.6  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  32.09 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  27.74 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.78 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1056  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  28.21 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  28.21 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  48.9  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  27.81 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  29.91 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3935  hypothetical protein  27.13 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.809511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  33.71 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.85 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  31.91 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2638  putative inner membrane protein  27.13 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  25.9 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  30.85 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  27.64 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  28.21 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  22.14 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  27.35 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  30.85 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  27.35 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  27.35 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  27.35 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  30.85 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  27.35 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0995  conserved hypothetical protein  27.13 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000205167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>