117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04042 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  54.05 
 
 		 190 aa  221  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  30.85 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  30.36 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  31.76 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  26.49 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  31.4 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  34.76 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  33.13 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  27.54 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  33.54 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  33.12 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  33.12 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  30.81 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  32.5 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  29.05 
 
 		 192 aa  98.2  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  33.54 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  29.68 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  26.58 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  25.29 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  31.72 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  34.48 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  27.32 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  30.18 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  33.94 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  32.32 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  30.34 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  31.25 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  27.06 
 
 		 214 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  31.03 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  27.92 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  27.61 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  29.34 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  31.54 
 
 		 416 aa  84.7  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.11 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  27.74 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  27.38 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  29.68 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  27.4 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  29.89 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  27.52 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  25.17 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  31.61 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  26.83 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  27.44 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  26.79 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  24.55 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  24.68 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  26.54 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  28.85 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  23.27 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.49 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  23.67 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  27.61 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  26.54 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  24.6 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 160 aa  52  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.15 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  25.41 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.44 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  30.23 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  30.57 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  30.43 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  31.39 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  26.39 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  26.39 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  30.6 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  26.39 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3715  membrane protein-like protein  27.08 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  27.08 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  28.57 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4193  membrane protein-like protein  27.46 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  28.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  26.76 
 
 		 143 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  30.22 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  30.82 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  30.14 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0088  hypothetical protein  30.6 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.24 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  24.66 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  24.86 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  28.47 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  30.22 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  29.94 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  23.29 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  28.79 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  27.82 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  27.74 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  23.29 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  27.01 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  29.13 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  27.27 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  25.7 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  27.94 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>