90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2076 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  380  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  69.23 
 
 		 195 aa  240  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  44.74 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  45.45 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  46.24 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  44.27 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  43.16 
 
 		 197 aa  151  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  39.69 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  43.11 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  43.5 
 
 		 205 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  37.78 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  41.36 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  41.38 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  40.23 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  42.86 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  38.66 
 
 		 192 aa  137  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  40.83 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  38.64 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  36.17 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  44.52 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  42.24 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  44.58 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  37.37 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  37.37 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  37.37 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  37.97 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  41.21 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  36.98 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  38.51 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  39.9 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  39.9 
 
 		 196 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  40.7 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  39.9 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  37.79 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  42.05 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  40.62 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  36.93 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  32.62 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  37.37 
 
 		 191 aa  121  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.06 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  36.98 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  37.91 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  37.43 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  43.62 
 
 		 416 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  29.69 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  38.89 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  38.62 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  37.87 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  27.65 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.23 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  28.85 
 
 		 190 aa  91.7  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  31.49 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  29.89 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  30.05 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  37.78 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  29.53 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  30.94 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  29.83 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  32.45 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  24.8 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  25.81 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  26.87 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.19 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  24.6 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  25.71 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  28.92 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  24 
 
 		 157 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  26.36 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  26.01 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  25.78 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.84 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.03 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  25.43 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.17 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  26.21 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  24.63 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11963  hypothetical protein  23.84 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  22.01 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  21.97 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  21.38 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  23.86 
 
 		 202 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 		 151 aa  42  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  22.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  29.08 
 
 		 228 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  22.73 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  20.93 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>