130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1342 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  94.9 
 
 
157 aa  295  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  92.36 
 
 
157 aa  291  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  57.96 
 
 
157 aa  197  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  53.64 
 
 
160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 
160 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  36.55 
 
 
160 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 
160 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  32.59 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  29.58 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  34.59 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  31.58 
 
 
200 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  24.29 
 
 
187 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  31.34 
 
 
212 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 
214 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  20.86 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
213 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.54 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  28.24 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  24.6 
 
 
195 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  28.87 
 
 
268 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  30.89 
 
 
212 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  30.95 
 
 
215 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  26.4 
 
 
192 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  24.66 
 
 
195 aa  47.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  30.36 
 
 
208 aa  47.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4633  hypothetical protein  25.95 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.49 
 
 
231 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  31.34 
 
 
213 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  28.89 
 
 
228 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  28.47 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 
237 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0535  putative transmembrane protein  25.95 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1579  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  22.9 
 
 
416 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.28 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  26.12 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  25.38 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  24.1 
 
 
200 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  26.89 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  28.24 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  22.14 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1129  hypothetical protein  26.72 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0566076  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  32.04 
 
 
249 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0365  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  27 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  28.1 
 
 
193 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  36.54 
 
 
203 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  25.83 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.81 
 
 
201 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  26.52 
 
 
193 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0386  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1504  hypothetical protein  24.24 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.552555  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0487  putative transmembrane protein  29.31 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.528398  normal  0.0272623 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1082  SNARE associated Golgi protein-related protein  25 
 
 
198 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  28.36 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  29.01 
 
 
209 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.77 
 
 
202 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2017  hypothetical protein  26.56 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0715199  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  29.32 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  21.21 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0366  hypothetical protein  23.23 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.47 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  27.21 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  27.78 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2687  hypothetical protein  23.89 
 
 
214 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493395  normal  0.468955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  24.56 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0574  hypothetical protein  24.81 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  28.09 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2910  hypothetical protein  25.37 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 
234 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  26.71 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  25.66 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  26.71 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.01 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  23.02 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  23.53 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  28.95 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  28.57 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  28.95 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  25.58 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  24.81 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.03 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  25.24 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  20.86 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  25.66 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  29.27 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  28.18 
 
 
211 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  22.22 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  23.18 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  30.84 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  25.78 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>