127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4633 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4633  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  310  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  72.26 
 
 		 160 aa  244  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1129  hypothetical protein  71.61 
 
 		 162 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0566076  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  70.51 
 
 		 160 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1579  hypothetical protein  68.18 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0487  putative transmembrane protein  69.68 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.528398  normal  0.0272623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0535  putative transmembrane protein  70.97 
 
 		 160 aa  229  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2910  hypothetical protein  63.37 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3587  hypothetical protein  62.64 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3029  hypothetical protein  66.67 
 
 		 181 aa  209  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1561  hypothetical protein  60.34 
 
 		 178 aa  207  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0426  hypothetical protein  52.84 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0343  hypothetical protein  52.3 
 
 		 193 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0328  putative transmembrane protein  53.45 
 
 		 193 aa  183  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0453  hypothetical protein  54.02 
 
 		 193 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0366  hypothetical protein  51.14 
 
 		 192 aa  179  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0574  hypothetical protein  55.33 
 
 		 167 aa  156  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1387  hypothetical protein  55.24 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  45.74 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4122  putative inner membrane protein  46.09 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002528  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03488  hypothetical protein  45.9 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2638  putative inner membrane protein  37.5 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2982  hypothetical protein  43.88 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0846  hypothetical protein  42.22 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797425  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3064  hypothetical protein  42.45 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3162  hypothetical protein  41.3 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1034  hypothetical protein  42.52 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3262  hypothetical protein  39.55 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.175834  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1130  hypothetical protein  39.55 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2534  hypothetical protein  44.96 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000278761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0692  hypothetical protein  43.18 
 
 		 137 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1096  hypothetical protein  39.55 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3561  hypothetical protein  41.91 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0020  SNARE associated Golgi protein  43.18 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1029  hypothetical protein  39.55 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3235  hypothetical protein  41.35 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000052813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3878  hypothetical protein  37.78 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0892  hypothetical protein  41.35 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000438982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3370  hypothetical protein  41.35 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000974791  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  39.1 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  38.06 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3169  hypothetical protein  39.1 
 
 		 142 aa  90.5  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0441375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1056  hypothetical protein  40.16 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  38.06 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3935  hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.809511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2972  hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000189151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02544  conserved inner membrane protein  38.93 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0995  conserved hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000205167  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02509  hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0129195  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1119  hypothetical protein  40.16 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000563823  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2825  hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  38.81 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1018  hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0859423  hitchhiker  0.00416875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2811  hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.000505734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3187  hypothetical protein  38.93 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000058062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  41.6 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1217  hypothetical protein  40.74 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.323612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1327  hypothetical protein  38.71 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0199997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3208  hypothetical protein  39.68 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000592602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0088  hypothetical protein  45.52 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3328  SNARE associated Golgi protein  39.23 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  37.23 
 
 		 146 aa  84  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1001  hypothetical protein  41.35 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453071  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  39.69 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0986  hypothetical protein  38.58 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  36.91 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0636  hypothetical protein  38.35 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  37.5 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3374  hypothetical protein  38.69 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  36.72 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2147  putative integral membrane protein  39.23 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.864762  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3715  membrane protein-like protein  37.21 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  35.16 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4193  membrane protein-like protein  36.72 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  35.16 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  37.9 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2938  hypothetical protein  36.97 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000195475  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3021  hypothetical protein  36.97 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0161641  hitchhiker  0.00000846709 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3004  hypothetical protein  36.97 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.055399  hitchhiker  0.00004287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2969  hypothetical protein  36.97 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0101702  hitchhiker  0.00077012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  34.38 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1618  SNARE associated Golgi protein  35.88 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  37.68 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3128  hypothetical protein  36.13 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  normal  0.0197186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2487  hypothetical protein  37.59 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0353  hypothetical protein  39.53 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28510  hypothetical protein  36.69 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1381  membrane protein-like protein  35.62 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0365  hypothetical protein  34.38 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  35.71 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1344  hypothetical protein  30.95 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0386  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  36.15 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  39.09 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  35.43 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2405  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>