52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0048 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  98.03 
 
 		 212 aa  393  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0045  hypothetical protein  91.63 
 
 		 203 aa  377  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0015548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0039  SNARE associated Golgi protein  36.3 
 
 		 152 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.123227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4387  hypothetical protein  33.1 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0729  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  33.57 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.21 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  28.38 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3262  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.175834  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1130  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  29.45 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1029  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3561  hypothetical protein  32.26 
 
 		 141 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1034  hypothetical protein  29.66 
 
 		 141 aa  51.6  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1096  hypothetical protein  32.26 
 
 		 141 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  27.7 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0652  SNARE associated Golgi protein  33.07 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297918  normal  0.0118286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1466  hypothetical protein  26.81 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  29.91 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  25.19 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  32.38 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3328  SNARE associated Golgi protein  31.46 
 
 		 140 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0986  hypothetical protein  29.59 
 
 		 142 aa  48.5  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  26.89 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  29.75 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1119  hypothetical protein  29.84 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000563823  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  26.25 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0644  hypothetical protein  21.64 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1327  hypothetical protein  32.58 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0199997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  27.1 
 
 		 714 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2982  hypothetical protein  27.05 
 
 		 141 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  28.68 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  27.88 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2017  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0715199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.3 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1217  hypothetical protein  31.87 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.323612  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  26.71 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3064  hypothetical protein  25.41 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  29.03 
 
 		 416 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.59 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  25.2 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  31.87 
 
 		 235 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  29.67 
 
 		 228 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3208  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000592602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3162  hypothetical protein  25.83 
 
 		 141 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  27.87 
 
 		 229 aa  41.2  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  30.13 
 
 		 235 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>