124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1606 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  100 
 
 		 416 aa  816    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  46.67 
 
 		 187 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  38.29 
 
 		 193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  42.47 
 
 		 193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  39.74 
 
 		 193 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  43.62 
 
 		 195 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  39.24 
 
 		 192 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  40.41 
 
 		 205 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  40.41 
 
 		 193 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  39.88 
 
 		 193 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  35.03 
 
 		 198 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  37.08 
 
 		 198 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  35.96 
 
 		 193 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  38.32 
 
 		 193 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  43.66 
 
 		 193 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  38.31 
 
 		 214 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  39.22 
 
 		 192 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  36.81 
 
 		 192 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  36.26 
 
 		 197 aa  106  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  39.19 
 
 		 192 aa  106  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  38.36 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  30.95 
 
 		 197 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  38.26 
 
 		 210 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  38.1 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  37.5 
 
 		 193 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  37.5 
 
 		 193 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  38.89 
 
 		 191 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 194 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  40.41 
 
 		 192 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  35.93 
 
 		 183 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  38.03 
 
 		 193 aa  99.8  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.54 
 
 		 195 aa  99.8  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  39.01 
 
 		 193 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  38.3 
 
 		 193 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  35.57 
 
 		 192 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  34.59 
 
 		 200 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  40.27 
 
 		 195 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.64 
 
 		 194 aa  90.1  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  29.47 
 
 		 212 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  36.43 
 
 		 160 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  34.18 
 
 		 215 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  37.14 
 
 		 160 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  35.33 
 
 		 204 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  32.17 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  30.54 
 
 		 191 aa  82.4  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  32.73 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  31.14 
 
 		 204 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  34.44 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.67 
 
 		 198 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  34.12 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  33.99 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  34.12 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  33.53 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  34.5 
 
 		 196 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.12 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  32.12 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  29.8 
 
 		 190 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  31.74 
 
 		 196 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  34.12 
 
 		 204 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  34.12 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  27.01 
 
 		 160 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  27.01 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.42 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  25.37 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  25.42 
 
 		 212 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  32.39 
 
 		 198 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  24.82 
 
 		 145 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  28.79 
 
 		 143 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 		 157 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  30 
 
 		 214 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  33.33 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.23 
 
 		 206 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 		 216 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  23.88 
 
 		 157 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.08 
 
 		 203 aa  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  26.9 
 
 		 143 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  29.5 
 
 		 207 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  26.39 
 
 		 212 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  31.39 
 
 		 225 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.87 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  24.09 
 
 		 145 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.77 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  25 
 
 		 202 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  25.53 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  26.56 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  29.29 
 
 		 206 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  24.44 
 
 		 145 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  22.98 
 
 		 195 aa  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  25.27 
 
 		 199 aa  47.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  24.44 
 
 		 145 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  22.9 
 
 		 157 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  23.7 
 
 		 146 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.32 
 
 		 207 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  26.78 
 
 		 203 aa  46.6  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  27.66 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  22.4 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  26.76 
 
 		 143 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.97 
 
 		 202 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  27.27 
 
 		 198 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>