76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0715 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0715  DedA family  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  86.39 
 
 		 193 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  84.82 
 
 		 193 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  83.25 
 
 		 193 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  74.35 
 
 		 193 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  72.92 
 
 		 198 aa  291  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  72.4 
 
 		 198 aa  288  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  61.58 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  58.29 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  58.29 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  57.75 
 
 		 193 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  56.38 
 
 		 193 aa  221  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  56.15 
 
 		 193 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  57.56 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  48.44 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  48.7 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  48.92 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  45.55 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  48.13 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  45.5 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  46.03 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  47.37 
 
 		 196 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  45.99 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  47.37 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  44.77 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  45.41 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  46.32 
 
 		 196 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  43.85 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  43.85 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  41.18 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  44.19 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  43.5 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  44.26 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  46.67 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  40.86 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  38.34 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  46.11 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  40.13 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  41.24 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  37.29 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  37.69 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.63 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  43.86 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  39.06 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  40.76 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  37.5 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  40.41 
 
 		 416 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  42.94 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  36.05 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  30.67 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.36 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  32.32 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  35.9 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  32.68 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  31.87 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  32.69 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  31.41 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  27.66 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  26.06 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  26.87 
 
 		 145 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  26.87 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.27 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.67 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  28.46 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  25.44 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  25.37 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  26.92 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  32.48 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  26.47 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  25.38 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  25.83 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  24.85 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>