67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3116 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  73.95 
 
 		 212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  49.21 
 
 		 193 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  45.31 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  46.88 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  48.96 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  47.15 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  45.26 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  46.11 
 
 		 193 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  46.11 
 
 		 193 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  46.56 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  47.69 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  44.68 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  44.15 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  44.15 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  44.21 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  41.94 
 
 		 193 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  43.85 
 
 		 193 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  43.23 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  43.62 
 
 		 194 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  42.53 
 
 		 192 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  38.74 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  39.68 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  43.68 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  44 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  38.3 
 
 		 192 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40.78 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  43.88 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  37.43 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  41.34 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  38.89 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  37.11 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  37.11 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  40.59 
 
 		 193 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  40.11 
 
 		 191 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  36.08 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  37.22 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  37.16 
 
 		 191 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  39.52 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  40.11 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.56 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  33.85 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  38.89 
 
 		 187 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  32.8 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  35.5 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  32.58 
 
 		 416 aa  89.4  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.61 
 
 		 194 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  27.32 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  30.5 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  27.52 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  26.09 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  29.65 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  28.64 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  31.75 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  28.06 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  28.03 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  28.17 
 
 		 160 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.84 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  31.71 
 
 		 157 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  29.24 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>