107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4083 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  53.93 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  42.6 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  32.03 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  30.86 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  31.9 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  31.9 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  29.01 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  32.52 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  27.61 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  30.67 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  32.97 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  28.85 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  30.49 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  28.07 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  28.97 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  28.97 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  28.97 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  31.72 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  30.25 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  32.75 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  26.35 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  28.86 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  26.04 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  28.28 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  32.86 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  32.08 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  29.59 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  28.15 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  24.86 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  31.74 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  26.88 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  31.08 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  28.97 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.4 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  29.45 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  33.56 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  32.9 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  26.17 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  26.11 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  28.82 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  24.55 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  26.11 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  29.8 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  30.94 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  32.07 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  24.84 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  32.07 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  23.84 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  23.84 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  26 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  22.76 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  23.18 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  21.38 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  32.09 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  30.94 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  30.94 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  30.94 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3715  membrane protein-like protein  30.94 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  30.22 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4193  membrane protein-like protein  30.22 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.66 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  28.37 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28510  hypothetical protein  32.14 
 
 		 147 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  29.5 
 
 		 143 aa  51.2  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  29.37 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  27.82 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  26.85 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  27.17 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  23.9 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  24.29 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2487  hypothetical protein  29.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  25 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  25.49 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  26.12 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.09 
 
 		 701 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  21.33 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  27.61 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.52 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  26.45 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  25.81 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0088  hypothetical protein  27.21 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  27.94 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  22.63 
 
 		 157 aa  45.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.03 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  27.13 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  27.94 
 
 		 145 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  23.53 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  23.81 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  23.53 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.66 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.93 
 
 		 202 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>