59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3998 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  75.77 
 
 		 196 aa  298  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  73.47 
 
 		 196 aa  296  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  74.74 
 
 		 196 aa  292  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  74.74 
 
 		 222 aa  292  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  69.07 
 
 		 195 aa  278  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  72.73 
 
 		 198 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  49.71 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  49.23 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  46.03 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  46.56 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  45.13 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  44.39 
 
 		 193 aa  158  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  44.39 
 
 		 193 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  44.39 
 
 		 193 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  45.5 
 
 		 193 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  46.84 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  44.62 
 
 		 198 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  46.56 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  46.33 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  43.65 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  42.42 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  42.78 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  42.86 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  42.05 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  40.72 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  43.43 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  37.63 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  38.46 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  39.66 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  42.05 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  46.32 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  37.36 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  38.42 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  35.52 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  34.41 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.47 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  32.83 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  39.76 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  35.67 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  38.71 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  37.13 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  31.79 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  36.47 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  32.94 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  31.93 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  32.54 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  26.83 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  26.11 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  31.74 
 
 		 416 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.72 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  27.89 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  28.05 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  27.14 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  22.44 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>