88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1280 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  46.88 
 
 		 192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  50.79 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  47.4 
 
 		 192 aa  170  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  49.46 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  48.42 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  49.47 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  47.89 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  47.89 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  46.88 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  47.06 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  48.13 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  47.06 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  46.24 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  46.52 
 
 		 193 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  45.99 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  40.1 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  46.07 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  47.06 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  44.33 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  45.83 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  44.04 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  43.81 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  45.35 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  43.81 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  42.42 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  45.51 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  46.88 
 
 		 200 aa  140  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  44.51 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  41.71 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  41.76 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  39.57 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  42.35 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  44.79 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  35.11 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  37.35 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  38.74 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  40.62 
 
 		 212 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  34.62 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  43.79 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  42.11 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  41.25 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  39.53 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.52 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  37.89 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  33.85 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  34.12 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  31.25 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.11 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  28.65 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  26.58 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  35.57 
 
 		 416 aa  94.4  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  32.56 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  32.82 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  31.01 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  32.28 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  28.99 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  32.28 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  26.92 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11963  hypothetical protein  29.66 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  28.12 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  27.07 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  21.97 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2237  membrane protein-like protein  32 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.564662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  22.9 
 
 		 157 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  26.43 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  22.95 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  26.09 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  23.85 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.74 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  22.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  26.36 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  26.36 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  26.15 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  26.92 
 
 		 145 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2259  transmembrane protein  31 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.867153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28510  hypothetical protein  27.48 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  23.45 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0933  transmembrane protein  30 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.590035 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  25.37 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  24.81 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  28.26 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  26.81 
 
 		 144 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  25 
 
 		 143 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>