57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3883 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  376  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  32.97 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  33.55 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  32.4 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  29.53 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  30.38 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  29.09 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  33.99 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  30.43 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  32.87 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  28.9 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  27.89 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  31.18 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  28.57 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  30.06 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  26.75 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  29.88 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  27.78 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  27.21 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  27.81 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  31.21 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  30.26 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  29.38 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  30.26 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  27.27 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  26.59 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  26.95 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  28.22 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  27.43 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  25 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  28.05 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  23.24 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  27.66 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  26.06 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  26.95 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  26.95 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  26.95 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  26.22 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  26.95 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  26.71 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  27.66 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  28.08 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  28.08 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  23.93 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  27.74 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  30.19 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  27.4 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  27.21 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  24 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  26.57 
 
 		 416 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  29.03 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>