79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0791 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  378  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  64.2 
 
 
193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  56.18 
 
 
183 aa  205  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  59.09 
 
 
194 aa  194  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  55.38 
 
 
193 aa  194  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  53.63 
 
 
195 aa  190  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  55.38 
 
 
191 aa  190  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  51.35 
 
 
192 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  47.37 
 
 
191 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  48.95 
 
 
192 aa  185  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  58.56 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  42.93 
 
 
204 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  48.82 
 
 
192 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  43.24 
 
 
192 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  42.93 
 
 
193 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  39.46 
 
 
204 aa  141  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  42.39 
 
 
193 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  47.06 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  42.39 
 
 
193 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  46.34 
 
 
193 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  40.66 
 
 
193 aa  134  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  42.35 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  37.17 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  41.4 
 
 
198 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  41.24 
 
 
205 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  43.02 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  43.43 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  40.86 
 
 
214 aa  128  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  44.05 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  44.79 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  40.7 
 
 
195 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  42.77 
 
 
198 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  42.51 
 
 
215 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  40.64 
 
 
212 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  42.94 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  42.33 
 
 
193 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  42.33 
 
 
193 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  43.1 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  33.17 
 
 
197 aa  117  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  45.27 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  38.58 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  38.83 
 
 
194 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  38.07 
 
 
204 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  43.24 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  39.69 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  38.42 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  36.36 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  39.2 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  39.2 
 
 
222 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  36.87 
 
 
198 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  39.88 
 
 
195 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  38.36 
 
 
416 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  38.8 
 
 
196 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  38.04 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  30.49 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  27.74 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  35.46 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  34.07 
 
 
160 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  30.54 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.1 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  28.22 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  29.23 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  28.24 
 
 
157 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  28.24 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 
230 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  30.16 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  30.33 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.44 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  29.37 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  29.37 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  24.81 
 
 
157 aa  44.7  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  29.91 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  25.35 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  32.54 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.26 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  25.86 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  26.52 
 
 
237 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>