194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0909 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0909  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0457691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0438  hypothetical protein  35.78 
 
 
212 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.562311  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
189 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  32.69 
 
 
164 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  41.77 
 
 
820 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 
421 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
187 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.9 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  30.25 
 
 
750 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
649 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.97 
 
 
462 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
620 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
1276 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
425 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  32 
 
 
205 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 
175 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
174 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  30.69 
 
 
929 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.73 
 
 
730 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
3560 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  25.68 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
446 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.9 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.09 
 
 
620 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  35.48 
 
 
581 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
927 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 
836 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.07 
 
 
289 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.38 
 
 
439 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
306 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  32.43 
 
 
1013 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  42.03 
 
 
306 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
191 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 
249 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
254 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 
249 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
4079 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 
988 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  34.69 
 
 
734 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.46 
 
 
746 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0624  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
192 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.63 
 
 
582 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
784 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
237 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.11 
 
 
439 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.9 
 
 
818 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
169 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  32.93 
 
 
519 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 
504 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
410 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
280 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
292 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  30.21 
 
 
564 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.21 
 
 
1979 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 
373 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 
233 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
357 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
301 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
360 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  34.02 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 
1056 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 
528 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
173 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 
192 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  35.44 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.41 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
629 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
515 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
594 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.41 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
1069 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  39.39 
 
 
739 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3839  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
593 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  24.14 
 
 
560 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
523 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
392 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  28.36 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
3035 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
213 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.46 
 
 
1022 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
452 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25 
 
 
706 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>